Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntn1P12960 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntn1P12960 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntn1P12960 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntn1P12960 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntn1P12960 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntn1P12960 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntn1P12960 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntn1P12960 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntn1P12960 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntn1P12960 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntn1P12960 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntn1P12960 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntn1P12960 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntn1P12960 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntn1P12960 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntn1P12960 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntn1P12960 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntn1P12960 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntn1P12960 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntn1P12960 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntn1P12960 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntn1P12960 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntn1P12960 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntn1P12960 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntn1P12960 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntn1P12960 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntn1P12960 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntn1P12960 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntn1P12960 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntn1P12960 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntn1P12960 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntn1P12960 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntn1P12960 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntn1P12960 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntn1P12960 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntn1P12960 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntn1P12960 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntn1P12960 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntn1P12960 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntn1P12960 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntn1P12960 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntn1P12960 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntn1P12960 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntn1P12960 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntn1P12960 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntn1P12960 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntn1P12960 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntn1P12960 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntn1P12960 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntn1P12960 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntn1P12960 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntn1P12960 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntn1P12960 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntn1P12960 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntn1P12960 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntn1P12960 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntn1P12960 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntn1P12960 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntn1P12960 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntn1P12960 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntn1P12960 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntn1P12960 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntn1P12960 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntn1P12960 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntn1P12960 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntn1P12960 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn1P12960 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn1P12960 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn1P12960 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn1P12960 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntn1P12960 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntn1P12960 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntn1P12960 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntn1P12960 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntn1P12960 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntn1P12960 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntn1P12960 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntn1P12960 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntn1P12960 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntn1P12960 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntn1P12960 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntn1P12960 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntn1P12960 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntn1P12960 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntn1P12960 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntn1P12960 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntn1P12960 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntn1P12960 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntn1P12960 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntn1P12960 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntn1P12960 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntn1P12960 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntn1P12960 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntn1P12960 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntn1P12960 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntn1P12960 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntn1P12960 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntn1P12960 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntn1P12960 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms