Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Prf1P10820 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Prf1P10820 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prf1P10820 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prf1P10820 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prf1P10820 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prf1P10820 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prf1P10820 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Prf1P10820 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prf1P10820 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prf1P10820 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Prf1P10820 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prf1P10820 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prf1P10820 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prf1P10820 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prf1P10820 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prf1P10820 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prf1P10820 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prf1P10820 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prf1P10820 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prf1P10820 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prf1P10820 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prf1P10820 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prf1P10820 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prf1P10820 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prf1P10820 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prf1P10820 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prf1P10820 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prf1P10820 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prf1P10820 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prf1P10820 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prf1P10820 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prf1P10820 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prf1P10820 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prf1P10820 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prf1P10820 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prf1P10820 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prf1P10820 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prf1P10820 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prf1P10820 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prf1P10820 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prf1P10820 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prf1P10820 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prf1P10820 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prf1P10820 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prf1P10820 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prf1P10820 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prf1P10820 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prf1P10820 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prf1P10820 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prf1P10820 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Prf1P10820 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prf1P10820 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prf1P10820 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prf1P10820 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prf1P10820 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prf1P10820 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prf1P10820 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prf1P10820 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prf1P10820 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prf1P10820 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prf1P10820 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prf1P10820 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prf1P10820 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prf1P10820 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prf1P10820 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prf1P10820 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prf1P10820 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prf1P10820 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prf1P10820 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prf1P10820 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Prf1P10820 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prf1P10820 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prf1P10820 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prf1P10820 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prf1P10820 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Prf1P10820 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prf1P10820 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prf1P10820 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prf1P10820 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Prf1P10820 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prf1P10820 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prf1P10820 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prf1P10820 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prf1P10820 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prf1P10820 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prf1P10820 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prf1P10820 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prf1P10820 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prf1P10820 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prf1P10820 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prf1P10820 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prf1P10820 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prf1P10820 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prf1P10820 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prf1P10820 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prf1P10820 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prf1P10820 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prf1P10820 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prf1P10820 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms