Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hoxc6P10629 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxc6P10629 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxc6P10629 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxc6P10629 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hoxc6P10629 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxc6P10629 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxc6P10629 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxc6P10629 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hoxc6P10629 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hoxc6P10629 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hoxc6P10629 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hoxc6P10629 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxc6P10629 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxc6P10629 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxc6P10629 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxc6P10629 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxc6P10629 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hoxc6P10629 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hoxc6P10629 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hoxc6P10629 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Hoxc6P10629 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxc6P10629 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxc6P10629 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxc6P10629 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hoxc6P10629 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hoxc6P10629 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Hoxc6P10629 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hoxc6P10629 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hoxc6P10629 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hoxc6P10629 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hoxc6P10629 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hoxc6P10629 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Hoxc6P10629 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hoxc6P10629 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Hoxc6P10629 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hoxc6P10629 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hoxc6P10629 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hoxc6P10629 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hoxc6P10629 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hoxc6P10629 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hoxc6P10629 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hoxc6P10629 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hoxc6P10629 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxc6P10629 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxc6P10629 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxc6P10629 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxc6P10629 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxc6P10629 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxc6P10629 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hoxc6P10629 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxc6P10629 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxc6P10629 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxc6P10629 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxc6P10629 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxc6P10629 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hoxc6P10629 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hoxc6P10629 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hoxc6P10629 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hoxc6P10629 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxc6P10629 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxc6P10629 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxc6P10629 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxc6P10629 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxc6P10629 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxc6P10629 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxc6P10629 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxc6P10629 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxc6P10629 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxc6P10629 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxc6P10629 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxc6P10629 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxc6P10629 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxc6P10629 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxc6P10629 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxc6P10629 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxc6P10629 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxc6P10629 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxc6P10629 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxc6P10629 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxc6P10629 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxc6P10629 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxc6P10629 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxc6P10629 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxc6P10629 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxc6P10629 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Hoxc6P10629 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Hoxc6P10629 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hoxc6P10629 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hoxc6P10629 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hoxc6P10629 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hoxc6P10629 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hoxc6P10629 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hoxc6P10629 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hoxc6P10629 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hoxc6P10629 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxc6P10629 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxc6P10629 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxc6P10629 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxc6P10629 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms