Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Schip1P0DPB4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Schip1P0DPB4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Schip1P0DPB4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Schip1P0DPB4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Schip1P0DPB4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Schip1P0DPB4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Schip1P0DPB4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Schip1P0DPB4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Schip1P0DPB4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Schip1P0DPB4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Schip1P0DPB4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Schip1P0DPB4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Schip1P0DPB4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Schip1P0DPB4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Schip1P0DPB4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Schip1P0DPB4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Schip1P0DPB4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Schip1P0DPB4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Schip1P0DPB4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Schip1P0DPB4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Schip1P0DPB4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Schip1P0DPB4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Schip1P0DPB4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Schip1P0DPB4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Schip1P0DPB4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Schip1P0DPB4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Schip1P0DPB4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Schip1P0DPB4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Schip1P0DPB4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Schip1P0DPB4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Schip1P0DPB4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Schip1P0DPB4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Schip1P0DPB4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Schip1P0DPB4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Schip1P0DPB4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Schip1P0DPB4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Schip1P0DPB4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Schip1P0DPB4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Schip1P0DPB4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Schip1P0DPB4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Schip1P0DPB4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Schip1P0DPB4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Schip1P0DPB4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Schip1P0DPB4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Schip1P0DPB4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Schip1P0DPB4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Schip1P0DPB4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Schip1P0DPB4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Schip1P0DPB4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Schip1P0DPB4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Schip1P0DPB4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Schip1P0DPB4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Schip1P0DPB4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Schip1P0DPB4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Schip1P0DPB4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Schip1P0DPB4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Schip1P0DPB4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Schip1P0DPB4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Schip1P0DPB4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Schip1P0DPB4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Schip1P0DPB4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Schip1P0DPB4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Schip1P0DPB4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Schip1P0DPB4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Schip1P0DPB4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Schip1P0DPB4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Schip1P0DPB4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Schip1P0DPB4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Schip1P0DPB4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Schip1P0DPB4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Schip1P0DPB4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Schip1P0DPB4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Schip1P0DPB4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Schip1P0DPB4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Schip1P0DPB4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Schip1P0DPB4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Schip1P0DPB4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Schip1P0DPB4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Schip1P0DPB4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Schip1P0DPB4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Schip1P0DPB4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Schip1P0DPB4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Schip1P0DPB4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Schip1P0DPB4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Schip1P0DPB4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Schip1P0DPB4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Schip1P0DPB4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Schip1P0DPB4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Schip1P0DPB4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Schip1P0DPB4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Schip1P0DPB4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Schip1P0DPB4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Schip1P0DPB4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Schip1P0DPB4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Schip1P0DPB4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Schip1P0DPB4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Schip1P0DPB4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Schip1P0DPB4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Schip1P0DPB4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms