Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NefmP08553 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NefmP08553 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NefmP08553 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NefmP08553 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NefmP08553 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NefmP08553 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
NefmP08553 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
NefmP08553 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
NefmP08553 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NefmP08553 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NefmP08553 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NefmP08553 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NefmP08553 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NefmP08553 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
NefmP08553 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NefmP08553 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NefmP08553 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NefmP08553 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NefmP08553 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NefmP08553 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NefmP08553 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NefmP08553 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NefmP08553 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NefmP08553 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NefmP08553 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NefmP08553 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NefmP08553 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NefmP08553 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NefmP08553 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NefmP08553 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NefmP08553 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NefmP08553 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NefmP08553 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NefmP08553 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NefmP08553 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NefmP08553 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NefmP08553 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
NefmP08553 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NefmP08553 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NefmP08553 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NefmP08553 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NefmP08553 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NefmP08553 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NefmP08553 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NefmP08553 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
NefmP08553 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NefmP08553 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NefmP08553 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NefmP08553 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NefmP08553 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NefmP08553 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NefmP08553 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NefmP08553 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NefmP08553 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NefmP08553 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NefmP08553 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
NefmP08553 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NefmP08553 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NefmP08553 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NefmP08553 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NefmP08553 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NefmP08553 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NefmP08553 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NefmP08553 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
NefmP08553 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NefmP08553 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NefmP08553 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NefmP08553 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NefmP08553 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NefmP08553 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NefmP08553 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NefmP08553 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NefmP08553 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NefmP08553 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NefmP08553 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NefmP08553 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NefmP08553 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NefmP08553 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NefmP08553 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NefmP08553 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NefmP08553 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NefmP08553 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NefmP08553 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NefmP08553 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NefmP08553 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NefmP08553 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NefmP08553 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NefmP08553 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NefmP08553 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NefmP08553 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NefmP08553 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NefmP08553 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NefmP08553 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NefmP08553 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NefmP08553 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NefmP08553 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NefmP08553 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NefmP08553 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NefmP08553 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms