Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtrP07309 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtrP07309 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtrP07309 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtrP07309 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtrP07309 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtrP07309 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtrP07309 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtrP07309 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtrP07309 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtrP07309 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtrP07309 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtrP07309 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtrP07309 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtrP07309 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtrP07309 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtrP07309 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtrP07309 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtrP07309 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TtrP07309 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtrP07309 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TtrP07309 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TtrP07309 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TtrP07309 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtrP07309 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtrP07309 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtrP07309 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtrP07309 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtrP07309 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtrP07309 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtrP07309 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtrP07309 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtrP07309 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtrP07309 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtrP07309 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtrP07309 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtrP07309 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtrP07309 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TtrP07309 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtrP07309 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtrP07309 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtrP07309 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtrP07309 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtrP07309 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtrP07309 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtrP07309 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtrP07309 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TtrP07309 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TtrP07309 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TtrP07309 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtrP07309 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtrP07309 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtrP07309 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtrP07309 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtrP07309 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtrP07309 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtrP07309 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtrP07309 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtrP07309 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TtrP07309 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TtrP07309 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtrP07309 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtrP07309 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtrP07309 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtrP07309 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtrP07309 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtrP07309 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtrP07309 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtrP07309 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtrP07309 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtrP07309 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtrP07309 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtrP07309 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtrP07309 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtrP07309 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtrP07309 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtrP07309 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtrP07309 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtrP07309 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtrP07309 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtrP07309 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtrP07309 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtrP07309 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtrP07309 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtrP07309 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtrP07309 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtrP07309 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtrP07309 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtrP07309 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtrP07309 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TtrP07309 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtrP07309 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtrP07309 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtrP07309 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtrP07309 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtrP07309 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtrP07309 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtrP07309 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtrP07309 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtrP07309 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms