Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TnfP06804 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TnfP06804 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TnfP06804 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TnfP06804 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TnfP06804 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TnfP06804 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TnfP06804 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TnfP06804 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TnfP06804 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TnfP06804 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TnfP06804 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TnfP06804 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TnfP06804 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TnfP06804 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TnfP06804 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TnfP06804 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TnfP06804 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TnfP06804 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TnfP06804 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TnfP06804 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TnfP06804 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TnfP06804 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TnfP06804 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TnfP06804 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TnfP06804 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TnfP06804 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TnfP06804 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TnfP06804 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TnfP06804 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TnfP06804 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TnfP06804 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TnfP06804 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TnfP06804 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TnfP06804 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TnfP06804 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TnfP06804 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TnfP06804 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TnfP06804 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TnfP06804 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TnfP06804 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TnfP06804 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TnfP06804 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TnfP06804 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TnfP06804 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TnfP06804 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TnfP06804 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TnfP06804 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TnfP06804 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TnfP06804 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TnfP06804 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TnfP06804 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TnfP06804 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TnfP06804 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TnfP06804 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TnfP06804 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TnfP06804 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TnfP06804 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TnfP06804 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TnfP06804 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TnfP06804 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TnfP06804 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TnfP06804 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TnfP06804 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TnfP06804 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TnfP06804 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TnfP06804 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TnfP06804 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TnfP06804 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TnfP06804 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TnfP06804 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TnfP06804 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TnfP06804 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TnfP06804 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TnfP06804 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TnfP06804 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TnfP06804 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TnfP06804 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TnfP06804 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TnfP06804 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TnfP06804 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TnfP06804 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TnfP06804 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TnfP06804 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TnfP06804 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TnfP06804 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TnfP06804 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TnfP06804 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TnfP06804 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TnfP06804 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TnfP06804 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TnfP06804 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TnfP06804 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TnfP06804 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TnfP06804 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TnfP06804 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TnfP06804 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TnfP06804 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TnfP06804 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TnfP06804 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms