Protein–RNA interactions for Protein: P05977

Myl1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl1P05977 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Myl1P05977 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Myl1P05977 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Myl1P05977 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Myl1P05977 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Myl1P05977 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Myl1P05977 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Myl1P05977 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Myl1P05977 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Myl1P05977 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Myl1P05977 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Myl1P05977 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Myl1P05977 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Myl1P05977 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Myl1P05977 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Myl1P05977 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Myl1P05977 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Myl1P05977 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Myl1P05977 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Myl1P05977 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Myl1P05977 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Myl1P05977 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Myl1P05977 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Myl1P05977 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Myl1P05977 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Myl1P05977 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Myl1P05977 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Myl1P05977 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Myl1P05977 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Myl1P05977 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Myl1P05977 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Myl1P05977 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Myl1P05977 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Myl1P05977 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Myl1P05977 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Myl1P05977 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Myl1P05977 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Myl1P05977 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Myl1P05977 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Myl1P05977 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Myl1P05977 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Myl1P05977 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Myl1P05977 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Myl1P05977 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Myl1P05977 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Myl1P05977 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Myl1P05977 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Myl1P05977 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Myl1P05977 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Myl1P05977 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Myl1P05977 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Myl1P05977 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Myl1P05977 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Myl1P05977 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Myl1P05977 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Myl1P05977 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Myl1P05977 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Myl1P05977 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Myl1P05977 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Myl1P05977 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Myl1P05977 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Myl1P05977 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Myl1P05977 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Myl1P05977 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Myl1P05977 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Myl1P05977 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Myl1P05977 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Myl1P05977 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Myl1P05977 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Myl1P05977 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Myl1P05977 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Myl1P05977 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Myl1P05977 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Myl1P05977 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Myl1P05977 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Myl1P05977 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Myl1P05977 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myl1P05977 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myl1P05977 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myl1P05977 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myl1P05977 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Myl1P05977 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Myl1P05977 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Myl1P05977 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Myl1P05977 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Myl1P05977 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Myl1P05977 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Myl1P05977 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myl1P05977 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myl1P05977 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myl1P05977 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myl1P05977 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myl1P05977 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myl1P05977 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myl1P05977 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myl1P05977 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Myl1P05977 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myl1P05977 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Myl1P05977 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Myl1P05977 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms