Protein–RNA interactions for Protein: P04186

Cfb, Complement factor B, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CfbP04186 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CfbP04186 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CfbP04186 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CfbP04186 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CfbP04186 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CfbP04186 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CfbP04186 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CfbP04186 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CfbP04186 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CfbP04186 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CfbP04186 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CfbP04186 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CfbP04186 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CfbP04186 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CfbP04186 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CfbP04186 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CfbP04186 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CfbP04186 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CfbP04186 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CfbP04186 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CfbP04186 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CfbP04186 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CfbP04186 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CfbP04186 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CfbP04186 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CfbP04186 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CfbP04186 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CfbP04186 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CfbP04186 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CfbP04186 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CfbP04186 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CfbP04186 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CfbP04186 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CfbP04186 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CfbP04186 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CfbP04186 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CfbP04186 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CfbP04186 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CfbP04186 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CfbP04186 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CfbP04186 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CfbP04186 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CfbP04186 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CfbP04186 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CfbP04186 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CfbP04186 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CfbP04186 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CfbP04186 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CfbP04186 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CfbP04186 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CfbP04186 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CfbP04186 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CfbP04186 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CfbP04186 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CfbP04186 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CfbP04186 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CfbP04186 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CfbP04186 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CfbP04186 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CfbP04186 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CfbP04186 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CfbP04186 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CfbP04186 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CfbP04186 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CfbP04186 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CfbP04186 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CfbP04186 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CfbP04186 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CfbP04186 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CfbP04186 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CfbP04186 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CfbP04186 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CfbP04186 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CfbP04186 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CfbP04186 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CfbP04186 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CfbP04186 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CfbP04186 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CfbP04186 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CfbP04186 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CfbP04186 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CfbP04186 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CfbP04186 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CfbP04186 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CfbP04186 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CfbP04186 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CfbP04186 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CfbP04186 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CfbP04186 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CfbP04186 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CfbP04186 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CfbP04186 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CfbP04186 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CfbP04186 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CfbP04186 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CfbP04186 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CfbP04186 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CfbP04186 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CfbP04186 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CfbP04186 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms