Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P01673 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
P01673 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P01673 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P01673 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
P01673 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
P01673 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
P01673 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
P01673 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
P01673 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P01673 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P01673 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
P01673 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
P01673 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
P01673 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
P01673 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P01673 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01673 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01673 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01673 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P01673 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P01673 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P01673 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
P01673 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
P01673 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01673 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
P01673 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01673 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P01673 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
P01673 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01673 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01673 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01673 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
P01673 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P01673 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P01673 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P01673 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01673 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01673 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P01673 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01673 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01673 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01673 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01673 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01673 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01673 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01673 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01673 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P01673 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P01673 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
P01673 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P01673 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P01673 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
P01673 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01673 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01673 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01673 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01673 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
P01673 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01673 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
P01673 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01673 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01673 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01673 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01673 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01673 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01673 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01673 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01673 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01673 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01673 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01673 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01673 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01673 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
P01673 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P01673 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01673 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01673 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01673 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01673 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01673 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01673 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01673 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01673 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01673 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01673 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01673 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01673 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01673 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01673 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01673 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01673 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01673 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01673 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01673 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01673 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01673 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01673 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01673 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01673 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms