Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01638 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01638 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01638 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01638 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01638 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01638 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
P01638 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
P01638 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
P01638 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01638 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01638 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01638 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01638 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01638 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01638 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01638 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
P01638 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01638 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01638 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01638 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01638 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01638 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01638 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01638 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01638 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01638 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
P01638 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01638 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01638 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01638 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01638 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01638 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01638 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01638 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01638 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01638 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
P01638 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01638 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01638 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
P01638 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01638 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
P01638 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01638 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01638 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
P01638 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01638 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01638 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01638 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01638 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
P01638 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P01638 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
P01638 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01638 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01638 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01638 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01638 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01638 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01638 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01638 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01638 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
P01638 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01638 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01638 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01638 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01638 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01638 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01638 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01638 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01638 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
P01638 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01638 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01638 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01638 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01638 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
P01638 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01638 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01638 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01638 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01638 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01638 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01638 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01638 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01638 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01638 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01638 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01638 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01638 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01638 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01638 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01638 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01638 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01638 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01638 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01638 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01638 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
P01638 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01638 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01638 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01638 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms