Protein–RNA interactions for Protein: P01629

Ig kappa chain V-II region 2S1.3, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01629 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23■■□□□ 1.27
P01629 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01629 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01629 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01629 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01629 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01629 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01629 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01629 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01629 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01629 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01629 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01629 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01629 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01629 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01629 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01629 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01629 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
P01629 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01629 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01629 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01629 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01629 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01629 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01629 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01629 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01629 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
P01629 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01629 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01629 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01629 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
P01629 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01629 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01629 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01629 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01629 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01629 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01629 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01629 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01629 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01629 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01629 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01629 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01629 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01629 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01629 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01629 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01629 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01629 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01629 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01629 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01629 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01629 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01629 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01629 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01629 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01629 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01629 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01629 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01629 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01629 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01629 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01629 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01629 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01629 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01629 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01629 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01629 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01629 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01629 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01629 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01629 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01629 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01629 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01629 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01629 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01629 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
P01629 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01629 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01629 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01629 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01629 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01629 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01629 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01629 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01629 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01629 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01629 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01629 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01629 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01629 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01629 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01629 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01629 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01629 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01629 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01629 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01629 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01629 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01629 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms