Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vti1aO89116 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vti1aO89116 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vti1aO89116 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vti1aO89116 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Vti1aO89116 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Vti1aO89116 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vti1aO89116 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vti1aO89116 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vti1aO89116 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vti1aO89116 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vti1aO89116 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vti1aO89116 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vti1aO89116 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vti1aO89116 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Vti1aO89116 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vti1aO89116 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vti1aO89116 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vti1aO89116 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vti1aO89116 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vti1aO89116 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vti1aO89116 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vti1aO89116 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vti1aO89116 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vti1aO89116 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vti1aO89116 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vti1aO89116 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vti1aO89116 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vti1aO89116 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vti1aO89116 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Vti1aO89116 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vti1aO89116 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Vti1aO89116 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vti1aO89116 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vti1aO89116 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vti1aO89116 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vti1aO89116 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vti1aO89116 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vti1aO89116 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vti1aO89116 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Vti1aO89116 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vti1aO89116 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vti1aO89116 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vti1aO89116 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vti1aO89116 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vti1aO89116 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vti1aO89116 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vti1aO89116 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vti1aO89116 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vti1aO89116 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vti1aO89116 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vti1aO89116 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vti1aO89116 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vti1aO89116 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vti1aO89116 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vti1aO89116 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vti1aO89116 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vti1aO89116 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vti1aO89116 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vti1aO89116 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vti1aO89116 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vti1aO89116 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Vti1aO89116 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vti1aO89116 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vti1aO89116 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vti1aO89116 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vti1aO89116 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vti1aO89116 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vti1aO89116 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Vti1aO89116 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vti1aO89116 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vti1aO89116 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vti1aO89116 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vti1aO89116 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vti1aO89116 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Vti1aO89116 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vti1aO89116 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vti1aO89116 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vti1aO89116 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vti1aO89116 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vti1aO89116 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vti1aO89116 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vti1aO89116 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vti1aO89116 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vti1aO89116 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vti1aO89116 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vti1aO89116 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vti1aO89116 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vti1aO89116 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vti1aO89116 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vti1aO89116 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vti1aO89116 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vti1aO89116 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vti1aO89116 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Vti1aO89116 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vti1aO89116 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vti1aO89116 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vti1aO89116 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vti1aO89116 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vti1aO89116 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms