Protein–RNA interactions for Protein: O89103

Cd93, Complement component C1q receptor, mousemouse

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd93O89103 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd93O89103 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd93O89103 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd93O89103 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd93O89103 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd93O89103 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd93O89103 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cd93O89103 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd93O89103 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd93O89103 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd93O89103 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd93O89103 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd93O89103 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd93O89103 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd93O89103 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd93O89103 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd93O89103 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd93O89103 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd93O89103 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd93O89103 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd93O89103 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd93O89103 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd93O89103 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd93O89103 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd93O89103 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd93O89103 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd93O89103 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd93O89103 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd93O89103 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd93O89103 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd93O89103 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd93O89103 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd93O89103 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd93O89103 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd93O89103 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd93O89103 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd93O89103 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd93O89103 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd93O89103 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd93O89103 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd93O89103 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd93O89103 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd93O89103 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd93O89103 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd93O89103 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd93O89103 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd93O89103 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd93O89103 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd93O89103 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd93O89103 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd93O89103 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd93O89103 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd93O89103 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd93O89103 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd93O89103 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd93O89103 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd93O89103 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd93O89103 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd93O89103 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd93O89103 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd93O89103 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd93O89103 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd93O89103 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd93O89103 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd93O89103 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd93O89103 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cd93O89103 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd93O89103 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd93O89103 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd93O89103 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd93O89103 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd93O89103 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd93O89103 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd93O89103 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd93O89103 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd93O89103 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd93O89103 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd93O89103 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd93O89103 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd93O89103 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd93O89103 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd93O89103 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd93O89103 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd93O89103 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd93O89103 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd93O89103 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd93O89103 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd93O89103 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd93O89103 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd93O89103 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd93O89103 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd93O89103 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd93O89103 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd93O89103 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd93O89103 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd93O89103 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd93O89103 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd93O89103 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd93O89103 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd93O89103 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms