Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CpdO89001 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CpdO89001 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CpdO89001 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CpdO89001 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CpdO89001 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CpdO89001 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CpdO89001 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CpdO89001 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CpdO89001 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CpdO89001 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CpdO89001 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CpdO89001 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CpdO89001 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CpdO89001 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CpdO89001 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CpdO89001 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CpdO89001 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CpdO89001 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CpdO89001 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CpdO89001 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CpdO89001 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CpdO89001 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CpdO89001 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CpdO89001 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CpdO89001 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CpdO89001 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CpdO89001 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CpdO89001 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CpdO89001 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CpdO89001 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CpdO89001 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CpdO89001 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CpdO89001 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CpdO89001 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CpdO89001 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CpdO89001 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CpdO89001 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CpdO89001 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CpdO89001 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CpdO89001 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CpdO89001 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CpdO89001 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CpdO89001 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CpdO89001 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CpdO89001 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CpdO89001 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CpdO89001 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CpdO89001 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CpdO89001 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CpdO89001 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CpdO89001 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CpdO89001 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CpdO89001 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CpdO89001 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CpdO89001 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CpdO89001 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CpdO89001 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CpdO89001 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CpdO89001 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CpdO89001 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CpdO89001 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CpdO89001 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CpdO89001 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CpdO89001 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CpdO89001 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CpdO89001 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CpdO89001 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CpdO89001 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CpdO89001 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CpdO89001 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CpdO89001 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CpdO89001 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CpdO89001 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CpdO89001 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CpdO89001 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CpdO89001 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CpdO89001 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CpdO89001 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CpdO89001 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CpdO89001 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CpdO89001 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CpdO89001 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CpdO89001 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CpdO89001 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CpdO89001 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CpdO89001 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CpdO89001 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CpdO89001 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CpdO89001 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CpdO89001 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CpdO89001 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CpdO89001 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CpdO89001 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CpdO89001 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CpdO89001 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CpdO89001 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CpdO89001 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CpdO89001 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CpdO89001 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms