Protein–RNA interactions for Protein: O88848

Arl6, ADP-ribosylation factor-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6O88848 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arl6O88848 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arl6O88848 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arl6O88848 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arl6O88848 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arl6O88848 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arl6O88848 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arl6O88848 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arl6O88848 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arl6O88848 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arl6O88848 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arl6O88848 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arl6O88848 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arl6O88848 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arl6O88848 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arl6O88848 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arl6O88848 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arl6O88848 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arl6O88848 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Arl6O88848 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arl6O88848 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arl6O88848 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arl6O88848 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arl6O88848 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arl6O88848 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arl6O88848 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arl6O88848 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arl6O88848 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arl6O88848 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arl6O88848 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Arl6O88848 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arl6O88848 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arl6O88848 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arl6O88848 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arl6O88848 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arl6O88848 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arl6O88848 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arl6O88848 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arl6O88848 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arl6O88848 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arl6O88848 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arl6O88848 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arl6O88848 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arl6O88848 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arl6O88848 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arl6O88848 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arl6O88848 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arl6O88848 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arl6O88848 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Arl6O88848 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arl6O88848 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arl6O88848 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arl6O88848 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arl6O88848 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arl6O88848 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Arl6O88848 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arl6O88848 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arl6O88848 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arl6O88848 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arl6O88848 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arl6O88848 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arl6O88848 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arl6O88848 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arl6O88848 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arl6O88848 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arl6O88848 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arl6O88848 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Arl6O88848 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arl6O88848 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arl6O88848 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arl6O88848 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arl6O88848 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arl6O88848 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arl6O88848 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arl6O88848 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arl6O88848 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Arl6O88848 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arl6O88848 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arl6O88848 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arl6O88848 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Arl6O88848 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arl6O88848 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arl6O88848 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arl6O88848 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arl6O88848 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arl6O88848 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arl6O88848 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arl6O88848 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arl6O88848 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arl6O88848 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arl6O88848 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arl6O88848 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arl6O88848 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arl6O88848 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arl6O88848 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arl6O88848 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arl6O88848 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arl6O88848 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arl6O88848 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arl6O88848 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms