Protein–RNA interactions for Protein: O70200

Aif1, Allograft inflammatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aif1O70200 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Aif1O70200 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Aif1O70200 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aif1O70200 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aif1O70200 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aif1O70200 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aif1O70200 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aif1O70200 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aif1O70200 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aif1O70200 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aif1O70200 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aif1O70200 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aif1O70200 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aif1O70200 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aif1O70200 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aif1O70200 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aif1O70200 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Aif1O70200 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aif1O70200 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aif1O70200 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aif1O70200 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Aif1O70200 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Aif1O70200 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aif1O70200 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aif1O70200 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aif1O70200 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aif1O70200 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Aif1O70200 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aif1O70200 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aif1O70200 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aif1O70200 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aif1O70200 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aif1O70200 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aif1O70200 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aif1O70200 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aif1O70200 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aif1O70200 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aif1O70200 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aif1O70200 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aif1O70200 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aif1O70200 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Aif1O70200 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aif1O70200 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aif1O70200 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aif1O70200 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aif1O70200 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aif1O70200 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aif1O70200 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aif1O70200 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aif1O70200 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aif1O70200 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aif1O70200 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aif1O70200 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aif1O70200 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aif1O70200 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Aif1O70200 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aif1O70200 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aif1O70200 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aif1O70200 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aif1O70200 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aif1O70200 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aif1O70200 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aif1O70200 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aif1O70200 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aif1O70200 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aif1O70200 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aif1O70200 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Aif1O70200 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Aif1O70200 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aif1O70200 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aif1O70200 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aif1O70200 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aif1O70200 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aif1O70200 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aif1O70200 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aif1O70200 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aif1O70200 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aif1O70200 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aif1O70200 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aif1O70200 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aif1O70200 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aif1O70200 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aif1O70200 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aif1O70200 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aif1O70200 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aif1O70200 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aif1O70200 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aif1O70200 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aif1O70200 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aif1O70200 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aif1O70200 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aif1O70200 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aif1O70200 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aif1O70200 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aif1O70200 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aif1O70200 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aif1O70200 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aif1O70200 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aif1O70200 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aif1O70200 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms