Protein–RNA interactions for Protein: O55222

Ilk, Integrin-linked protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IlkO55222 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IlkO55222 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IlkO55222 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IlkO55222 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IlkO55222 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IlkO55222 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IlkO55222 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IlkO55222 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IlkO55222 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IlkO55222 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IlkO55222 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IlkO55222 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IlkO55222 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IlkO55222 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IlkO55222 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IlkO55222 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IlkO55222 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IlkO55222 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IlkO55222 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IlkO55222 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IlkO55222 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IlkO55222 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IlkO55222 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IlkO55222 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IlkO55222 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IlkO55222 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IlkO55222 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IlkO55222 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IlkO55222 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IlkO55222 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IlkO55222 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IlkO55222 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IlkO55222 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IlkO55222 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IlkO55222 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IlkO55222 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IlkO55222 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IlkO55222 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IlkO55222 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IlkO55222 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IlkO55222 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IlkO55222 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IlkO55222 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IlkO55222 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IlkO55222 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IlkO55222 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IlkO55222 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IlkO55222 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IlkO55222 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IlkO55222 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IlkO55222 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IlkO55222 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IlkO55222 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IlkO55222 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IlkO55222 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IlkO55222 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IlkO55222 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IlkO55222 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IlkO55222 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IlkO55222 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IlkO55222 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IlkO55222 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IlkO55222 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IlkO55222 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IlkO55222 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IlkO55222 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IlkO55222 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IlkO55222 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IlkO55222 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IlkO55222 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IlkO55222 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IlkO55222 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IlkO55222 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IlkO55222 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IlkO55222 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IlkO55222 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IlkO55222 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IlkO55222 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IlkO55222 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IlkO55222 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IlkO55222 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IlkO55222 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IlkO55222 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IlkO55222 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IlkO55222 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IlkO55222 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IlkO55222 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IlkO55222 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
IlkO55222 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IlkO55222 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IlkO55222 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IlkO55222 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IlkO55222 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IlkO55222 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IlkO55222 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IlkO55222 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IlkO55222 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IlkO55222 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IlkO55222 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IlkO55222 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms