Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cbx4O55187 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cbx4O55187 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cbx4O55187 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cbx4O55187 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cbx4O55187 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cbx4O55187 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cbx4O55187 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cbx4O55187 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cbx4O55187 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cbx4O55187 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cbx4O55187 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cbx4O55187 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cbx4O55187 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cbx4O55187 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cbx4O55187 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cbx4O55187 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cbx4O55187 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cbx4O55187 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cbx4O55187 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cbx4O55187 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cbx4O55187 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cbx4O55187 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cbx4O55187 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cbx4O55187 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cbx4O55187 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cbx4O55187 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cbx4O55187 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cbx4O55187 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cbx4O55187 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cbx4O55187 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cbx4O55187 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cbx4O55187 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cbx4O55187 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cbx4O55187 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cbx4O55187 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cbx4O55187 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cbx4O55187 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cbx4O55187 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cbx4O55187 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cbx4O55187 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cbx4O55187 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx4O55187 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx4O55187 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cbx4O55187 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cbx4O55187 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cbx4O55187 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cbx4O55187 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cbx4O55187 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cbx4O55187 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cbx4O55187 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx4O55187 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx4O55187 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx4O55187 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx4O55187 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx4O55187 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cbx4O55187 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cbx4O55187 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cbx4O55187 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cbx4O55187 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cbx4O55187 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cbx4O55187 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cbx4O55187 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cbx4O55187 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cbx4O55187 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cbx4O55187 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx4O55187 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx4O55187 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx4O55187 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx4O55187 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cbx4O55187 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cbx4O55187 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cbx4O55187 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cbx4O55187 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cbx4O55187 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cbx4O55187 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cbx4O55187 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cbx4O55187 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx4O55187 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx4O55187 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx4O55187 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx4O55187 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cbx4O55187 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cbx4O55187 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cbx4O55187 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cbx4O55187 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cbx4O55187 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cbx4O55187 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cbx4O55187 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx4O55187 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx4O55187 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx4O55187 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx4O55187 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx4O55187 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx4O55187 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx4O55187 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx4O55187 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx4O55187 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx4O55187 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx4O55187 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms