Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
StrnO55106 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
StrnO55106 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
StrnO55106 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
StrnO55106 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
StrnO55106 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
StrnO55106 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
StrnO55106 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
StrnO55106 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
StrnO55106 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
StrnO55106 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
StrnO55106 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
StrnO55106 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
StrnO55106 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
StrnO55106 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
StrnO55106 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
StrnO55106 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
StrnO55106 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
StrnO55106 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
StrnO55106 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
StrnO55106 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
StrnO55106 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
StrnO55106 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
StrnO55106 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
StrnO55106 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
StrnO55106 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
StrnO55106 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
StrnO55106 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
StrnO55106 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
StrnO55106 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
StrnO55106 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
StrnO55106 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
StrnO55106 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
StrnO55106 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
StrnO55106 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
StrnO55106 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
StrnO55106 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
StrnO55106 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
StrnO55106 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
StrnO55106 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
StrnO55106 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
StrnO55106 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
StrnO55106 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
StrnO55106 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
StrnO55106 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
StrnO55106 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
StrnO55106 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
StrnO55106 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
StrnO55106 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
StrnO55106 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
StrnO55106 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
StrnO55106 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
StrnO55106 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
StrnO55106 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
StrnO55106 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
StrnO55106 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
StrnO55106 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
StrnO55106 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
StrnO55106 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
StrnO55106 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
StrnO55106 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
StrnO55106 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
StrnO55106 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
StrnO55106 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
StrnO55106 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
StrnO55106 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
StrnO55106 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
StrnO55106 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
StrnO55106 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
StrnO55106 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
StrnO55106 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
StrnO55106 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
StrnO55106 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
StrnO55106 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
StrnO55106 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
StrnO55106 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
StrnO55106 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
StrnO55106 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
StrnO55106 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
StrnO55106 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
StrnO55106 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
StrnO55106 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
StrnO55106 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
StrnO55106 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
StrnO55106 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
StrnO55106 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
StrnO55106 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
StrnO55106 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
StrnO55106 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
StrnO55106 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
StrnO55106 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
StrnO55106 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
StrnO55106 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
StrnO55106 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
StrnO55106 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
StrnO55106 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
StrnO55106 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
StrnO55106 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
StrnO55106 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
StrnO55106 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms