Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnk2O54967 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnk2O54967 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnk2O54967 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnk2O54967 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnk2O54967 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnk2O54967 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnk2O54967 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnk2O54967 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnk2O54967 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tnk2O54967 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tnk2O54967 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnk2O54967 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnk2O54967 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnk2O54967 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnk2O54967 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnk2O54967 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnk2O54967 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnk2O54967 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnk2O54967 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnk2O54967 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnk2O54967 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnk2O54967 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnk2O54967 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnk2O54967 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnk2O54967 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnk2O54967 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnk2O54967 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnk2O54967 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnk2O54967 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tnk2O54967 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnk2O54967 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnk2O54967 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnk2O54967 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnk2O54967 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnk2O54967 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnk2O54967 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnk2O54967 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnk2O54967 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnk2O54967 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnk2O54967 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnk2O54967 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnk2O54967 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnk2O54967 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnk2O54967 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnk2O54967 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnk2O54967 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnk2O54967 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnk2O54967 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnk2O54967 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnk2O54967 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnk2O54967 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnk2O54967 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnk2O54967 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnk2O54967 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnk2O54967 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnk2O54967 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnk2O54967 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnk2O54967 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnk2O54967 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnk2O54967 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnk2O54967 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnk2O54967 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnk2O54967 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnk2O54967 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnk2O54967 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnk2O54967 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnk2O54967 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnk2O54967 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnk2O54967 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnk2O54967 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnk2O54967 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnk2O54967 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnk2O54967 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnk2O54967 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnk2O54967 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnk2O54967 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnk2O54967 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnk2O54967 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnk2O54967 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnk2O54967 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnk2O54967 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnk2O54967 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnk2O54967 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnk2O54967 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnk2O54967 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnk2O54967 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnk2O54967 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnk2O54967 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnk2O54967 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnk2O54967 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnk2O54967 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnk2O54967 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnk2O54967 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnk2O54967 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnk2O54967 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnk2O54967 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnk2O54967 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnk2O54967 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnk2O54967 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms