Protein–RNA interactions for Protein: O54950

Prkag1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkag1O54950 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Prkag1O54950 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Prkag1O54950 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Prkag1O54950 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Prkag1O54950 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24,97■■□□□ 1,59
Prkag1O54950 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24,97■■□□□ 1,59
Prkag1O54950 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Prkag1O54950 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Prkag1O54950 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Prkag1O54950 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Prkag1O54950 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,59
Prkag1O54950 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24,95■■□□□ 1,58
Prkag1O54950 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Prkag1O54950 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Prkag1O54950 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Prkag1O54950 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Prkag1O54950 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Prkag1O54950 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Prkag1O54950 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Prkag1O54950 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24,92■■□□□ 1,58
Prkag1O54950 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24,92■■□□□ 1,58
Prkag1O54950 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24,92■■□□□ 1,58
Prkag1O54950 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Prkag1O54950 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Prkag1O54950 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Prkag1O54950 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Prkag1O54950 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Prkag1O54950 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Prkag1O54950 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Prkag1O54950 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Prkag1O54950 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24,87■■□□□ 1,57
Prkag1O54950 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24,87■■□□□ 1,57
Prkag1O54950 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Prkag1O54950 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Prkag1O54950 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Prkag1O54950 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Prkag1O54950 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Prkag1O54950 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Prkag1O54950 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Prkag1O54950 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Prkag1O54950 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Prkag1O54950 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Prkag1O54950 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24,83■■□□□ 1,57
Prkag1O54950 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24,83■■□□□ 1,57
Prkag1O54950 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Prkag1O54950 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Prkag1O54950 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Prkag1O54950 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Prkag1O54950 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,81■■□□□ 1,56
Prkag1O54950 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Prkag1O54950 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Prkag1O54950 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Prkag1O54950 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Prkag1O54950 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Prkag1O54950 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Prkag1O54950 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Prkag1O54950 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Prkag1O54950 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,78■■□□□ 1,56
Prkag1O54950 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Prkag1O54950 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,78■■□□□ 1,56
Prkag1O54950 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Prkag1O54950 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Prkag1O54950 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Prkag1O54950 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Prkag1O54950 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Prkag1O54950 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Prkag1O54950 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Prkag1O54950 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Prkag1O54950 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Prkag1O54950 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Prkag1O54950 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,75■■□□□ 1,55
Prkag1O54950 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Prkag1O54950 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Prkag1O54950 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Prkag1O54950 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Prkag1O54950 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24,73■■□□□ 1,55
Prkag1O54950 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24,72■■□□□ 1,55
Prkag1O54950 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24,72■■□□□ 1,55
Prkag1O54950 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Prkag1O54950 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Prkag1O54950 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Prkag1O54950 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Prkag1O54950 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Prkag1O54950 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24,69■■□□□ 1,54
Prkag1O54950 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Prkag1O54950 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Prkag1O54950 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24,68■■□□□ 1,54
Prkag1O54950 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Prkag1O54950 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Prkag1O54950 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Prkag1O54950 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24,64■■□□□ 1,54
Prkag1O54950 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24,64■■□□□ 1,54
Prkag1O54950 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Prkag1O54950 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Prkag1O54950 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Prkag1O54950 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Prkag1O54950 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Prkag1O54950 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Prkag1O54950 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Prkag1O54950 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,2 ms