Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lgals6O54891 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lgals6O54891 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lgals6O54891 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lgals6O54891 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lgals6O54891 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lgals6O54891 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lgals6O54891 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lgals6O54891 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lgals6O54891 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lgals6O54891 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lgals6O54891 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgals6O54891 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgals6O54891 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgals6O54891 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgals6O54891 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgals6O54891 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgals6O54891 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgals6O54891 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgals6O54891 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lgals6O54891 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgals6O54891 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgals6O54891 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgals6O54891 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lgals6O54891 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgals6O54891 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgals6O54891 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgals6O54891 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgals6O54891 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgals6O54891 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lgals6O54891 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lgals6O54891 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lgals6O54891 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lgals6O54891 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lgals6O54891 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lgals6O54891 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lgals6O54891 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lgals6O54891 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lgals6O54891 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lgals6O54891 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lgals6O54891 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lgals6O54891 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lgals6O54891 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lgals6O54891 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lgals6O54891 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lgals6O54891 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lgals6O54891 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lgals6O54891 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lgals6O54891 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lgals6O54891 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lgals6O54891 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lgals6O54891 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lgals6O54891 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lgals6O54891 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lgals6O54891 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms