Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnfrsf18O35714 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnfrsf18O35714 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnfrsf18O35714 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnfrsf18O35714 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnfrsf18O35714 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnfrsf18O35714 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnfrsf18O35714 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnfrsf18O35714 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnfrsf18O35714 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnfrsf18O35714 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnfrsf18O35714 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnfrsf18O35714 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnfrsf18O35714 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnfrsf18O35714 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnfrsf18O35714 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnfrsf18O35714 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnfrsf18O35714 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnfrsf18O35714 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnfrsf18O35714 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnfrsf18O35714 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnfrsf18O35714 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnfrsf18O35714 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnfrsf18O35714 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnfrsf18O35714 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tnfrsf18O35714 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnfrsf18O35714 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnfrsf18O35714 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnfrsf18O35714 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnfrsf18O35714 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnfrsf18O35714 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnfrsf18O35714 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnfrsf18O35714 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnfrsf18O35714 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnfrsf18O35714 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnfrsf18O35714 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnfrsf18O35714 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tnfrsf18O35714 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tnfrsf18O35714 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tnfrsf18O35714 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnfrsf18O35714 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnfrsf18O35714 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnfrsf18O35714 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnfrsf18O35714 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnfrsf18O35714 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnfrsf18O35714 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnfrsf18O35714 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnfrsf18O35714 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnfrsf18O35714 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnfrsf18O35714 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnfrsf18O35714 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnfrsf18O35714 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnfrsf18O35714 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnfrsf18O35714 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnfrsf18O35714 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnfrsf18O35714 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnfrsf18O35714 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnfrsf18O35714 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnfrsf18O35714 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnfrsf18O35714 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnfrsf18O35714 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnfrsf18O35714 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnfrsf18O35714 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnfrsf18O35714 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnfrsf18O35714 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnfrsf18O35714 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnfrsf18O35714 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnfrsf18O35714 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnfrsf18O35714 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnfrsf18O35714 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnfrsf18O35714 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnfrsf18O35714 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnfrsf18O35714 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnfrsf18O35714 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnfrsf18O35714 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tnfrsf18O35714 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnfrsf18O35714 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnfrsf18O35714 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnfrsf18O35714 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnfrsf18O35714 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnfrsf18O35714 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnfrsf18O35714 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnfrsf18O35714 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnfrsf18O35714 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnfrsf18O35714 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnfrsf18O35714 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnfrsf18O35714 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnfrsf18O35714 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnfrsf18O35714 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnfrsf18O35714 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnfrsf18O35714 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnfrsf18O35714 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnfrsf18O35714 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnfrsf18O35714 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnfrsf18O35714 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnfrsf18O35714 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnfrsf18O35714 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnfrsf18O35714 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnfrsf18O35714 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnfrsf18O35714 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 203 ms