Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Stag2O35638 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Stag2O35638 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Stag2O35638 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Stag2O35638 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Stag2O35638 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Stag2O35638 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Stag2O35638 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Stag2O35638 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Stag2O35638 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Stag2O35638 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Stag2O35638 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stag2O35638 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stag2O35638 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Stag2O35638 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Stag2O35638 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Stag2O35638 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Stag2O35638 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stag2O35638 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stag2O35638 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stag2O35638 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stag2O35638 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stag2O35638 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stag2O35638 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stag2O35638 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stag2O35638 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stag2O35638 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stag2O35638 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stag2O35638 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stag2O35638 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Stag2O35638 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Stag2O35638 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Stag2O35638 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Stag2O35638 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stag2O35638 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stag2O35638 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stag2O35638 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stag2O35638 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Stag2O35638 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Stag2O35638 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Stag2O35638 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stag2O35638 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stag2O35638 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stag2O35638 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stag2O35638 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stag2O35638 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stag2O35638 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stag2O35638 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stag2O35638 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Stag2O35638 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Stag2O35638 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Stag2O35638 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stag2O35638 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stag2O35638 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stag2O35638 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stag2O35638 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Stag2O35638 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Stag2O35638 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Stag2O35638 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Stag2O35638 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stag2O35638 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stag2O35638 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stag2O35638 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Stag2O35638 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Stag2O35638 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Stag2O35638 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Stag2O35638 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Stag2O35638 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Stag2O35638 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Stag2O35638 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Stag2O35638 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Stag2O35638 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Stag2O35638 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Stag2O35638 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Stag2O35638 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Stag2O35638 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Stag2O35638 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Stag2O35638 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Stag2O35638 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Stag2O35638 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Stag2O35638 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Stag2O35638 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Stag2O35638 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Stag2O35638 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stag2O35638 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Stag2O35638 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Stag2O35638 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Stag2O35638 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Stag2O35638 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Stag2O35638 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Stag2O35638 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Stag2O35638 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Stag2O35638 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Stag2O35638 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stag2O35638 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stag2O35638 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stag2O35638 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stag2O35638 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stag2O35638 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stag2O35638 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms