Protein–RNA interactions for Protein: O35226

Psmd4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd4O35226 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd4O35226 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd4O35226 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd4O35226 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd4O35226 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd4O35226 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd4O35226 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd4O35226 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd4O35226 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd4O35226 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd4O35226 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd4O35226 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd4O35226 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd4O35226 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd4O35226 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmd4O35226 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmd4O35226 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmd4O35226 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmd4O35226 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmd4O35226 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmd4O35226 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmd4O35226 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmd4O35226 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmd4O35226 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmd4O35226 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmd4O35226 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd4O35226 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd4O35226 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd4O35226 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmd4O35226 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmd4O35226 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmd4O35226 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd4O35226 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd4O35226 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd4O35226 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd4O35226 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd4O35226 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd4O35226 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd4O35226 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd4O35226 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd4O35226 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd4O35226 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd4O35226 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd4O35226 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd4O35226 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd4O35226 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd4O35226 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd4O35226 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Psmd4O35226 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd4O35226 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd4O35226 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd4O35226 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd4O35226 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd4O35226 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd4O35226 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd4O35226 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd4O35226 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd4O35226 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd4O35226 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd4O35226 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd4O35226 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd4O35226 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd4O35226 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd4O35226 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd4O35226 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd4O35226 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd4O35226 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd4O35226 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd4O35226 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd4O35226 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd4O35226 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd4O35226 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd4O35226 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd4O35226 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd4O35226 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd4O35226 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd4O35226 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd4O35226 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd4O35226 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd4O35226 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd4O35226 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd4O35226 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd4O35226 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmd4O35226 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmd4O35226 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd4O35226 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd4O35226 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd4O35226 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd4O35226 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd4O35226 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd4O35226 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd4O35226 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd4O35226 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd4O35226 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd4O35226 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd4O35226 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd4O35226 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd4O35226 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd4O35226 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd4O35226 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms