Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cldn4O35054 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cldn4O35054 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cldn4O35054 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cldn4O35054 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cldn4O35054 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cldn4O35054 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cldn4O35054 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cldn4O35054 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cldn4O35054 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cldn4O35054 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cldn4O35054 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cldn4O35054 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cldn4O35054 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cldn4O35054 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cldn4O35054 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cldn4O35054 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cldn4O35054 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cldn4O35054 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cldn4O35054 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cldn4O35054 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cldn4O35054 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cldn4O35054 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cldn4O35054 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cldn4O35054 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cldn4O35054 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cldn4O35054 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cldn4O35054 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cldn4O35054 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cldn4O35054 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cldn4O35054 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cldn4O35054 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cldn4O35054 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cldn4O35054 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cldn4O35054 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cldn4O35054 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cldn4O35054 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cldn4O35054 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cldn4O35054 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cldn4O35054 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cldn4O35054 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cldn4O35054 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cldn4O35054 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cldn4O35054 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cldn4O35054 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cldn4O35054 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cldn4O35054 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cldn4O35054 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cldn4O35054 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cldn4O35054 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cldn4O35054 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cldn4O35054 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cldn4O35054 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cldn4O35054 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cldn4O35054 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cldn4O35054 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cldn4O35054 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cldn4O35054 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cldn4O35054 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cldn4O35054 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cldn4O35054 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cldn4O35054 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cldn4O35054 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cldn4O35054 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cldn4O35054 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cldn4O35054 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cldn4O35054 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cldn4O35054 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cldn4O35054 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cldn4O35054 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cldn4O35054 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cldn4O35054 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cldn4O35054 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cldn4O35054 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cldn4O35054 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cldn4O35054 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cldn4O35054 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cldn4O35054 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cldn4O35054 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cldn4O35054 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cldn4O35054 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cldn4O35054 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cldn4O35054 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cldn4O35054 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cldn4O35054 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cldn4O35054 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cldn4O35054 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cldn4O35054 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cldn4O35054 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cldn4O35054 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cldn4O35054 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cldn4O35054 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cldn4O35054 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cldn4O35054 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cldn4O35054 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cldn4O35054 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cldn4O35054 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cldn4O35054 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cldn4O35054 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cldn4O35054 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms