Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Barx2O08686 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Barx2O08686 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Barx2O08686 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Barx2O08686 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Barx2O08686 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Barx2O08686 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Barx2O08686 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Barx2O08686 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Barx2O08686 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Barx2O08686 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Barx2O08686 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Barx2O08686 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Barx2O08686 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Barx2O08686 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Barx2O08686 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Barx2O08686 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Barx2O08686 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Barx2O08686 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Barx2O08686 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Barx2O08686 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Barx2O08686 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Barx2O08686 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Barx2O08686 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Barx2O08686 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Barx2O08686 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Barx2O08686 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Barx2O08686 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Barx2O08686 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Barx2O08686 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Barx2O08686 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Barx2O08686 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Barx2O08686 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Barx2O08686 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Barx2O08686 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Barx2O08686 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Barx2O08686 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Barx2O08686 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Barx2O08686 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Barx2O08686 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Barx2O08686 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Barx2O08686 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Barx2O08686 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Barx2O08686 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Barx2O08686 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Barx2O08686 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Barx2O08686 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Barx2O08686 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Barx2O08686 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Barx2O08686 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Barx2O08686 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Barx2O08686 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Barx2O08686 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Barx2O08686 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Barx2O08686 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Barx2O08686 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Barx2O08686 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Barx2O08686 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Barx2O08686 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Barx2O08686 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Barx2O08686 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Barx2O08686 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Barx2O08686 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Barx2O08686 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Barx2O08686 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Barx2O08686 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Barx2O08686 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Barx2O08686 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Barx2O08686 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Barx2O08686 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Barx2O08686 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Barx2O08686 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Barx2O08686 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Barx2O08686 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Barx2O08686 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Barx2O08686 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Barx2O08686 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Barx2O08686 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Barx2O08686 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Barx2O08686 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Barx2O08686 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Barx2O08686 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Barx2O08686 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Barx2O08686 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Barx2O08686 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Barx2O08686 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Barx2O08686 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Barx2O08686 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Barx2O08686 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Barx2O08686 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Barx2O08686 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Barx2O08686 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Barx2O08686 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Barx2O08686 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Barx2O08686 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Barx2O08686 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Barx2O08686 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Barx2O08686 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Barx2O08686 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Barx2O08686 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms