Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema3aO08665 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema3aO08665 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema3aO08665 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema3aO08665 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema3aO08665 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sema3aO08665 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema3aO08665 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema3aO08665 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema3aO08665 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema3aO08665 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema3aO08665 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema3aO08665 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema3aO08665 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema3aO08665 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema3aO08665 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema3aO08665 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema3aO08665 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema3aO08665 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema3aO08665 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema3aO08665 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema3aO08665 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema3aO08665 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema3aO08665 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sema3aO08665 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sema3aO08665 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sema3aO08665 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema3aO08665 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema3aO08665 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema3aO08665 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema3aO08665 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema3aO08665 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema3aO08665 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema3aO08665 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema3aO08665 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema3aO08665 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema3aO08665 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema3aO08665 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema3aO08665 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema3aO08665 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema3aO08665 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema3aO08665 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema3aO08665 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema3aO08665 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema3aO08665 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema3aO08665 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema3aO08665 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema3aO08665 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema3aO08665 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema3aO08665 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema3aO08665 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema3aO08665 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema3aO08665 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema3aO08665 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema3aO08665 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema3aO08665 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema3aO08665 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema3aO08665 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema3aO08665 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema3aO08665 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema3aO08665 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema3aO08665 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema3aO08665 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema3aO08665 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema3aO08665 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema3aO08665 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema3aO08665 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema3aO08665 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema3aO08665 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema3aO08665 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema3aO08665 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema3aO08665 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema3aO08665 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema3aO08665 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema3aO08665 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema3aO08665 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema3aO08665 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema3aO08665 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema3aO08665 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema3aO08665 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema3aO08665 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema3aO08665 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sema3aO08665 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema3aO08665 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema3aO08665 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3aO08665 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3aO08665 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3aO08665 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3aO08665 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3aO08665 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema3aO08665 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema3aO08665 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema3aO08665 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema3aO08665 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema3aO08665 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema3aO08665 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema3aO08665 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema3aO08665 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema3aO08665 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema3aO08665 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms