Protein–RNA interactions for Protein: O08579

Emd, Emerin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EmdO08579 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EmdO08579 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EmdO08579 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EmdO08579 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EmdO08579 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
EmdO08579 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EmdO08579 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EmdO08579 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EmdO08579 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EmdO08579 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EmdO08579 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EmdO08579 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EmdO08579 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EmdO08579 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EmdO08579 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EmdO08579 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EmdO08579 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EmdO08579 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EmdO08579 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EmdO08579 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EmdO08579 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EmdO08579 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EmdO08579 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EmdO08579 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EmdO08579 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EmdO08579 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EmdO08579 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EmdO08579 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EmdO08579 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EmdO08579 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EmdO08579 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EmdO08579 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EmdO08579 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EmdO08579 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EmdO08579 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EmdO08579 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EmdO08579 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EmdO08579 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EmdO08579 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EmdO08579 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EmdO08579 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EmdO08579 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EmdO08579 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EmdO08579 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EmdO08579 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EmdO08579 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EmdO08579 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EmdO08579 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EmdO08579 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EmdO08579 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EmdO08579 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EmdO08579 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EmdO08579 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EmdO08579 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EmdO08579 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EmdO08579 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EmdO08579 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EmdO08579 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EmdO08579 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EmdO08579 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EmdO08579 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EmdO08579 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EmdO08579 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EmdO08579 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EmdO08579 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EmdO08579 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EmdO08579 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EmdO08579 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EmdO08579 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EmdO08579 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
EmdO08579 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EmdO08579 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EmdO08579 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EmdO08579 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EmdO08579 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EmdO08579 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EmdO08579 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EmdO08579 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EmdO08579 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EmdO08579 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EmdO08579 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EmdO08579 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EmdO08579 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EmdO08579 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EmdO08579 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EmdO08579 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EmdO08579 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EmdO08579 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EmdO08579 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EmdO08579 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EmdO08579 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EmdO08579 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EmdO08579 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EmdO08579 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EmdO08579 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EmdO08579 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EmdO08579 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EmdO08579 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EmdO08579 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EmdO08579 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms