Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc191J3QQ27 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc191J3QQ27 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc191J3QQ27 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc191J3QQ27 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc191J3QQ27 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc191J3QQ27 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc191J3QQ27 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc191J3QQ27 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc191J3QQ27 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc191J3QQ27 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc191J3QQ27 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc191J3QQ27 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc191J3QQ27 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc191J3QQ27 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc191J3QQ27 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc191J3QQ27 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc191J3QQ27 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc191J3QQ27 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc191J3QQ27 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc191J3QQ27 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc191J3QQ27 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc191J3QQ27 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc191J3QQ27 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc191J3QQ27 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc191J3QQ27 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc191J3QQ27 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc191J3QQ27 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc191J3QQ27 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc191J3QQ27 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc191J3QQ27 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc191J3QQ27 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc191J3QQ27 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc191J3QQ27 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc191J3QQ27 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc191J3QQ27 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc191J3QQ27 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc191J3QQ27 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc191J3QQ27 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc191J3QQ27 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc191J3QQ27 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc191J3QQ27 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc191J3QQ27 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc191J3QQ27 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc191J3QQ27 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc191J3QQ27 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc191J3QQ27 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc191J3QQ27 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc191J3QQ27 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc191J3QQ27 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc191J3QQ27 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc191J3QQ27 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc191J3QQ27 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc191J3QQ27 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc191J3QQ27 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc191J3QQ27 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc191J3QQ27 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc191J3QQ27 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc191J3QQ27 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc191J3QQ27 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc191J3QQ27 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc191J3QQ27 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc191J3QQ27 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc191J3QQ27 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc191J3QQ27 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc191J3QQ27 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc191J3QQ27 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc191J3QQ27 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc191J3QQ27 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc191J3QQ27 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc191J3QQ27 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc191J3QQ27 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc191J3QQ27 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc191J3QQ27 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc191J3QQ27 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc191J3QQ27 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc191J3QQ27 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc191J3QQ27 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc191J3QQ27 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc191J3QQ27 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc191J3QQ27 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc191J3QQ27 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc191J3QQ27 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc191J3QQ27 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc191J3QQ27 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc191J3QQ27 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc191J3QQ27 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc191J3QQ27 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc191J3QQ27 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc191J3QQ27 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc191J3QQ27 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc191J3QQ27 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc191J3QQ27 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc191J3QQ27 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc191J3QQ27 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc191J3QQ27 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc191J3QQ27 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc191J3QQ27 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc191J3QQ27 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms