Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm379J3QQ19 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm379J3QQ19 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm379J3QQ19 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm379J3QQ19 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm379J3QQ19 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm379J3QQ19 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm379J3QQ19 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm379J3QQ19 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm379J3QQ19 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm379J3QQ19 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm379J3QQ19 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm379J3QQ19 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm379J3QQ19 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm379J3QQ19 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm379J3QQ19 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm379J3QQ19 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm379J3QQ19 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm379J3QQ19 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm379J3QQ19 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm379J3QQ19 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm379J3QQ19 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm379J3QQ19 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm379J3QQ19 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm379J3QQ19 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm379J3QQ19 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm379J3QQ19 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm379J3QQ19 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm379J3QQ19 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm379J3QQ19 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm379J3QQ19 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm379J3QQ19 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm379J3QQ19 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm379J3QQ19 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm379J3QQ19 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm379J3QQ19 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm379J3QQ19 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm379J3QQ19 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm379J3QQ19 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm379J3QQ19 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm379J3QQ19 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm379J3QQ19 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm379J3QQ19 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm379J3QQ19 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm379J3QQ19 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm379J3QQ19 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm379J3QQ19 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm379J3QQ19 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm379J3QQ19 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm379J3QQ19 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm379J3QQ19 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm379J3QQ19 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm379J3QQ19 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm379J3QQ19 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm379J3QQ19 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm379J3QQ19 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm379J3QQ19 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm379J3QQ19 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm379J3QQ19 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm379J3QQ19 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm379J3QQ19 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm379J3QQ19 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm379J3QQ19 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm379J3QQ19 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm379J3QQ19 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm379J3QQ19 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm379J3QQ19 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm379J3QQ19 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm379J3QQ19 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm379J3QQ19 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm379J3QQ19 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm379J3QQ19 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm379J3QQ19 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm379J3QQ19 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm379J3QQ19 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm379J3QQ19 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm379J3QQ19 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm379J3QQ19 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm379J3QQ19 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm379J3QQ19 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm379J3QQ19 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm379J3QQ19 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm379J3QQ19 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm379J3QQ19 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm379J3QQ19 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm379J3QQ19 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm379J3QQ19 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm379J3QQ19 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm379J3QQ19 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm379J3QQ19 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm379J3QQ19 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm379J3QQ19 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm379J3QQ19 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm379J3QQ19 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm379J3QQ19 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm379J3QQ19 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm379J3QQ19 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm379J3QQ19 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm379J3QQ19 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm379J3QQ19 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
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