Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm8356J3QPD3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm8356J3QPD3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm8356J3QPD3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm8356J3QPD3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm8356J3QPD3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm8356J3QPD3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm8356J3QPD3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm8356J3QPD3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm8356J3QPD3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm8356J3QPD3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm8356J3QPD3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm8356J3QPD3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm8356J3QPD3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm8356J3QPD3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm8356J3QPD3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm8356J3QPD3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm8356J3QPD3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm8356J3QPD3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm8356J3QPD3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm8356J3QPD3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm8356J3QPD3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm8356J3QPD3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm8356J3QPD3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm8356J3QPD3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm8356J3QPD3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm8356J3QPD3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm8356J3QPD3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm8356J3QPD3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm8356J3QPD3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm8356J3QPD3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm8356J3QPD3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm8356J3QPD3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8356J3QPD3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8356J3QPD3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8356J3QPD3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8356J3QPD3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8356J3QPD3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm8356J3QPD3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm8356J3QPD3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8356J3QPD3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8356J3QPD3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8356J3QPD3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8356J3QPD3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8356J3QPD3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8356J3QPD3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm8356J3QPD3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8356J3QPD3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8356J3QPD3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8356J3QPD3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8356J3QPD3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8356J3QPD3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8356J3QPD3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm8356J3QPD3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm8356J3QPD3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm8356J3QPD3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm8356J3QPD3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm8356J3QPD3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm8356J3QPD3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm8356J3QPD3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm8356J3QPD3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm8356J3QPD3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm8356J3QPD3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm8356J3QPD3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm8356J3QPD3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm8356J3QPD3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8356J3QPD3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8356J3QPD3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm8356J3QPD3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm8356J3QPD3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm8356J3QPD3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8356J3QPD3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8356J3QPD3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8356J3QPD3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm8356J3QPD3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm8356J3QPD3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm8356J3QPD3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8356J3QPD3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8356J3QPD3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8356J3QPD3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8356J3QPD3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8356J3QPD3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8356J3QPD3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm8356J3QPD3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm8356J3QPD3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm8356J3QPD3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm8356J3QPD3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm8356J3QPD3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm8356J3QPD3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm8356J3QPD3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8356J3QPD3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8356J3QPD3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8356J3QPD3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm8356J3QPD3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm8356J3QPD3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm8356J3QPD3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm8356J3QPD3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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