Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Arid4aF8VPQ2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Arid4aF8VPQ2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Arid4aF8VPQ2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Arid4aF8VPQ2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Arid4aF8VPQ2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Arid4aF8VPQ2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29,3■■■□□ 2,28
Arid4aF8VPQ2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Arid4aF8VPQ2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Arid4aF8VPQ2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Arid4aF8VPQ2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Arid4aF8VPQ2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Arid4aF8VPQ2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Arid4aF8VPQ2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Arid4aF8VPQ2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Arid4aF8VPQ2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Arid4aF8VPQ2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Arid4aF8VPQ2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Arid4aF8VPQ2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Arid4aF8VPQ2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Arid4aF8VPQ2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Arid4aF8VPQ2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Arid4aF8VPQ2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Arid4aF8VPQ2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Arid4aF8VPQ2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Arid4aF8VPQ2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Arid4aF8VPQ2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29,18■■■□□ 2,26
Arid4aF8VPQ2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Arid4aF8VPQ2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Arid4aF8VPQ2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Arid4aF8VPQ2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Arid4aF8VPQ2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Arid4aF8VPQ2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Arid4aF8VPQ2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Arid4aF8VPQ2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Arid4aF8VPQ2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Arid4aF8VPQ2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Arid4aF8VPQ2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Arid4aF8VPQ2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Arid4aF8VPQ2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Arid4aF8VPQ2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Arid4aF8VPQ2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Arid4aF8VPQ2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Arid4aF8VPQ2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Arid4aF8VPQ2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Arid4aF8VPQ2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Arid4aF8VPQ2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Arid4aF8VPQ2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Arid4aF8VPQ2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Arid4aF8VPQ2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Arid4aF8VPQ2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Arid4aF8VPQ2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Arid4aF8VPQ2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Arid4aF8VPQ2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Arid4aF8VPQ2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Arid4aF8VPQ2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Arid4aF8VPQ2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Arid4aF8VPQ2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Arid4aF8VPQ2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Arid4aF8VPQ2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Arid4aF8VPQ2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Arid4aF8VPQ2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Arid4aF8VPQ2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Arid4aF8VPQ2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Arid4aF8VPQ2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Arid4aF8VPQ2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Arid4aF8VPQ2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Arid4aF8VPQ2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,97■■■□□ 2,23
Arid4aF8VPQ2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Arid4aF8VPQ2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28,96■■■□□ 2,23
Arid4aF8VPQ2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Arid4aF8VPQ2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Arid4aF8VPQ2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Arid4aF8VPQ2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Arid4aF8VPQ2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Arid4aF8VPQ2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Arid4aF8VPQ2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Arid4aF8VPQ2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Arid4aF8VPQ2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Arid4aF8VPQ2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Arid4aF8VPQ2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Arid4aF8VPQ2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Arid4aF8VPQ2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Arid4aF8VPQ2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Arid4aF8VPQ2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Arid4aF8VPQ2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Arid4aF8VPQ2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Arid4aF8VPQ2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Arid4aF8VPQ2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28,84■■■□□ 2,21
Arid4aF8VPQ2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Arid4aF8VPQ2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Arid4aF8VPQ2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Arid4aF8VPQ2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Arid4aF8VPQ2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Arid4aF8VPQ2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Arid4aF8VPQ2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Arid4aF8VPQ2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Arid4aF8VPQ2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Arid4aF8VPQ2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Arid4aF8VPQ2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,1 ms