Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm17093F6XGJ4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm17093F6XGJ4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm17093F6XGJ4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm17093F6XGJ4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm17093F6XGJ4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm17093F6XGJ4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm17093F6XGJ4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm17093F6XGJ4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm17093F6XGJ4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm17093F6XGJ4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm17093F6XGJ4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm17093F6XGJ4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm17093F6XGJ4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm17093F6XGJ4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm17093F6XGJ4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm17093F6XGJ4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm17093F6XGJ4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm17093F6XGJ4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm17093F6XGJ4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm17093F6XGJ4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm17093F6XGJ4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm17093F6XGJ4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm17093F6XGJ4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm17093F6XGJ4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm17093F6XGJ4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm17093F6XGJ4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm17093F6XGJ4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm17093F6XGJ4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm17093F6XGJ4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm17093F6XGJ4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm17093F6XGJ4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm17093F6XGJ4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm17093F6XGJ4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm17093F6XGJ4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm17093F6XGJ4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm17093F6XGJ4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm17093F6XGJ4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm17093F6XGJ4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm17093F6XGJ4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm17093F6XGJ4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm17093F6XGJ4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm17093F6XGJ4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm17093F6XGJ4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm17093F6XGJ4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm17093F6XGJ4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm17093F6XGJ4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm17093F6XGJ4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm17093F6XGJ4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm17093F6XGJ4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm17093F6XGJ4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm17093F6XGJ4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm17093F6XGJ4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm17093F6XGJ4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm17093F6XGJ4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm17093F6XGJ4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm17093F6XGJ4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm17093F6XGJ4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm17093F6XGJ4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm17093F6XGJ4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm17093F6XGJ4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm17093F6XGJ4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm17093F6XGJ4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm17093F6XGJ4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm17093F6XGJ4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm17093F6XGJ4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm17093F6XGJ4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm17093F6XGJ4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm17093F6XGJ4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm17093F6XGJ4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm17093F6XGJ4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm17093F6XGJ4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm17093F6XGJ4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm17093F6XGJ4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm17093F6XGJ4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms