Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sptbn5F6UCX4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Sptbn5F6UCX4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sptbn5F6UCX4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sptbn5F6UCX4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sptbn5F6UCX4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sptbn5F6UCX4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sptbn5F6UCX4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sptbn5F6UCX4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sptbn5F6UCX4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sptbn5F6UCX4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sptbn5F6UCX4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sptbn5F6UCX4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sptbn5F6UCX4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sptbn5F6UCX4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sptbn5F6UCX4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sptbn5F6UCX4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sptbn5F6UCX4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Sptbn5F6UCX4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sptbn5F6UCX4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Sptbn5F6UCX4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Sptbn5F6UCX4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sptbn5F6UCX4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sptbn5F6UCX4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sptbn5F6UCX4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sptbn5F6UCX4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sptbn5F6UCX4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sptbn5F6UCX4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sptbn5F6UCX4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sptbn5F6UCX4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sptbn5F6UCX4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sptbn5F6UCX4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sptbn5F6UCX4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sptbn5F6UCX4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sptbn5F6UCX4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sptbn5F6UCX4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sptbn5F6UCX4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sptbn5F6UCX4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sptbn5F6UCX4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sptbn5F6UCX4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sptbn5F6UCX4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sptbn5F6UCX4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Sptbn5F6UCX4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sptbn5F6UCX4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sptbn5F6UCX4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sptbn5F6UCX4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sptbn5F6UCX4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sptbn5F6UCX4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sptbn5F6UCX4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sptbn5F6UCX4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sptbn5F6UCX4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sptbn5F6UCX4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sptbn5F6UCX4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sptbn5F6UCX4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sptbn5F6UCX4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sptbn5F6UCX4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sptbn5F6UCX4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sptbn5F6UCX4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sptbn5F6UCX4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sptbn5F6UCX4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sptbn5F6UCX4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sptbn5F6UCX4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sptbn5F6UCX4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sptbn5F6UCX4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sptbn5F6UCX4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sptbn5F6UCX4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sptbn5F6UCX4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sptbn5F6UCX4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sptbn5F6UCX4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sptbn5F6UCX4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sptbn5F6UCX4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sptbn5F6UCX4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sptbn5F6UCX4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Sptbn5F6UCX4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sptbn5F6UCX4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sptbn5F6UCX4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sptbn5F6UCX4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sptbn5F6UCX4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sptbn5F6UCX4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sptbn5F6UCX4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sptbn5F6UCX4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sptbn5F6UCX4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sptbn5F6UCX4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sptbn5F6UCX4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sptbn5F6UCX4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sptbn5F6UCX4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sptbn5F6UCX4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sptbn5F6UCX4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sptbn5F6UCX4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sptbn5F6UCX4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sptbn5F6UCX4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sptbn5F6UCX4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sptbn5F6UCX4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sptbn5F6UCX4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sptbn5F6UCX4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sptbn5F6UCX4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sptbn5F6UCX4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sptbn5F6UCX4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sptbn5F6UCX4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sptbn5F6UCX4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms