Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srp54bE9PXC0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Srp54bE9PXC0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srp54bE9PXC0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srp54bE9PXC0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srp54bE9PXC0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srp54bE9PXC0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srp54bE9PXC0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srp54bE9PXC0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srp54bE9PXC0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srp54bE9PXC0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srp54bE9PXC0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srp54bE9PXC0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srp54bE9PXC0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srp54bE9PXC0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srp54bE9PXC0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srp54bE9PXC0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Srp54bE9PXC0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Srp54bE9PXC0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srp54bE9PXC0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srp54bE9PXC0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srp54bE9PXC0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srp54bE9PXC0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Srp54bE9PXC0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srp54bE9PXC0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srp54bE9PXC0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srp54bE9PXC0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srp54bE9PXC0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srp54bE9PXC0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srp54bE9PXC0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srp54bE9PXC0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srp54bE9PXC0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srp54bE9PXC0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srp54bE9PXC0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srp54bE9PXC0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srp54bE9PXC0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srp54bE9PXC0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srp54bE9PXC0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srp54bE9PXC0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srp54bE9PXC0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srp54bE9PXC0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srp54bE9PXC0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Srp54bE9PXC0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srp54bE9PXC0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Srp54bE9PXC0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srp54bE9PXC0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srp54bE9PXC0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srp54bE9PXC0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srp54bE9PXC0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Srp54bE9PXC0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srp54bE9PXC0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srp54bE9PXC0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srp54bE9PXC0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srp54bE9PXC0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srp54bE9PXC0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srp54bE9PXC0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srp54bE9PXC0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srp54bE9PXC0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srp54bE9PXC0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srp54bE9PXC0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srp54bE9PXC0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srp54bE9PXC0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srp54bE9PXC0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srp54bE9PXC0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Srp54bE9PXC0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srp54bE9PXC0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srp54bE9PXC0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srp54bE9PXC0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srp54bE9PXC0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srp54bE9PXC0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srp54bE9PXC0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srp54bE9PXC0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srp54bE9PXC0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Srp54bE9PXC0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Srp54bE9PXC0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Srp54bE9PXC0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srp54bE9PXC0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srp54bE9PXC0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srp54bE9PXC0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srp54bE9PXC0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srp54bE9PXC0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srp54bE9PXC0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srp54bE9PXC0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srp54bE9PXC0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srp54bE9PXC0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srp54bE9PXC0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srp54bE9PXC0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srp54bE9PXC0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Srp54bE9PXC0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Srp54bE9PXC0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Srp54bE9PXC0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Srp54bE9PXC0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srp54bE9PXC0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srp54bE9PXC0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srp54bE9PXC0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srp54bE9PXC0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Srp54bE9PXC0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Srp54bE9PXC0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Srp54bE9PXC0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Srp54bE9PXC0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms