Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc78D3Z5T1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc78D3Z5T1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc78D3Z5T1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc78D3Z5T1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc78D3Z5T1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc78D3Z5T1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc78D3Z5T1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc78D3Z5T1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc78D3Z5T1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc78D3Z5T1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc78D3Z5T1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc78D3Z5T1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc78D3Z5T1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc78D3Z5T1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc78D3Z5T1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc78D3Z5T1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc78D3Z5T1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc78D3Z5T1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc78D3Z5T1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc78D3Z5T1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc78D3Z5T1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc78D3Z5T1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc78D3Z5T1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc78D3Z5T1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc78D3Z5T1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc78D3Z5T1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc78D3Z5T1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc78D3Z5T1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc78D3Z5T1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc78D3Z5T1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc78D3Z5T1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc78D3Z5T1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc78D3Z5T1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc78D3Z5T1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc78D3Z5T1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc78D3Z5T1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc78D3Z5T1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc78D3Z5T1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc78D3Z5T1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc78D3Z5T1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc78D3Z5T1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc78D3Z5T1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc78D3Z5T1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc78D3Z5T1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc78D3Z5T1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc78D3Z5T1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc78D3Z5T1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc78D3Z5T1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc78D3Z5T1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc78D3Z5T1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc78D3Z5T1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc78D3Z5T1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc78D3Z5T1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc78D3Z5T1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc78D3Z5T1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc78D3Z5T1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc78D3Z5T1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc78D3Z5T1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc78D3Z5T1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc78D3Z5T1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc78D3Z5T1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc78D3Z5T1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc78D3Z5T1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc78D3Z5T1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc78D3Z5T1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc78D3Z5T1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc78D3Z5T1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc78D3Z5T1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc78D3Z5T1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc78D3Z5T1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc78D3Z5T1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc78D3Z5T1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc78D3Z5T1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc78D3Z5T1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc78D3Z5T1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc78D3Z5T1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc78D3Z5T1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc78D3Z5T1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc78D3Z5T1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc78D3Z5T1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc78D3Z5T1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc78D3Z5T1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc78D3Z5T1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc78D3Z5T1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc78D3Z5T1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc78D3Z5T1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc78D3Z5T1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc78D3Z5T1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc78D3Z5T1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc78D3Z5T1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc78D3Z5T1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc78D3Z5T1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc78D3Z5T1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc78D3Z5T1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc78D3Z5T1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc78D3Z5T1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc78D3Z5T1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc78D3Z5T1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc78D3Z5T1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms