Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3U4

9630041A04Rik, RIKEN cDNA 9630041A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9630041A04RikD3Z3U4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
9630041A04RikD3Z3U4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
9630041A04RikD3Z3U4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
9630041A04RikD3Z3U4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
9630041A04RikD3Z3U4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
9630041A04RikD3Z3U4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
9630041A04RikD3Z3U4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
9630041A04RikD3Z3U4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
9630041A04RikD3Z3U4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
9630041A04RikD3Z3U4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
9630041A04RikD3Z3U4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
9630041A04RikD3Z3U4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
9630041A04RikD3Z3U4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
9630041A04RikD3Z3U4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
9630041A04RikD3Z3U4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
9630041A04RikD3Z3U4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
9630041A04RikD3Z3U4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
9630041A04RikD3Z3U4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
9630041A04RikD3Z3U4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
9630041A04RikD3Z3U4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
9630041A04RikD3Z3U4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
9630041A04RikD3Z3U4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
9630041A04RikD3Z3U4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
9630041A04RikD3Z3U4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
9630041A04RikD3Z3U4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
9630041A04RikD3Z3U4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
9630041A04RikD3Z3U4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
9630041A04RikD3Z3U4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
9630041A04RikD3Z3U4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
9630041A04RikD3Z3U4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
9630041A04RikD3Z3U4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
9630041A04RikD3Z3U4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
9630041A04RikD3Z3U4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
9630041A04RikD3Z3U4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
9630041A04RikD3Z3U4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
9630041A04RikD3Z3U4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
9630041A04RikD3Z3U4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
9630041A04RikD3Z3U4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
9630041A04RikD3Z3U4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
9630041A04RikD3Z3U4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
9630041A04RikD3Z3U4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
9630041A04RikD3Z3U4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
9630041A04RikD3Z3U4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
9630041A04RikD3Z3U4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
9630041A04RikD3Z3U4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
9630041A04RikD3Z3U4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
9630041A04RikD3Z3U4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
9630041A04RikD3Z3U4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
9630041A04RikD3Z3U4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24■■□□□ 1.43
9630041A04RikD3Z3U4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24■■□□□ 1.43
9630041A04RikD3Z3U4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
9630041A04RikD3Z3U4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
9630041A04RikD3Z3U4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
9630041A04RikD3Z3U4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
9630041A04RikD3Z3U4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
9630041A04RikD3Z3U4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
9630041A04RikD3Z3U4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
9630041A04RikD3Z3U4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
9630041A04RikD3Z3U4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
9630041A04RikD3Z3U4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
9630041A04RikD3Z3U4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
9630041A04RikD3Z3U4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
9630041A04RikD3Z3U4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
9630041A04RikD3Z3U4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
9630041A04RikD3Z3U4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
9630041A04RikD3Z3U4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
9630041A04RikD3Z3U4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
9630041A04RikD3Z3U4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
9630041A04RikD3Z3U4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
9630041A04RikD3Z3U4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
9630041A04RikD3Z3U4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
9630041A04RikD3Z3U4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
9630041A04RikD3Z3U4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
9630041A04RikD3Z3U4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
9630041A04RikD3Z3U4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
9630041A04RikD3Z3U4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
9630041A04RikD3Z3U4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
9630041A04RikD3Z3U4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
9630041A04RikD3Z3U4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
9630041A04RikD3Z3U4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
9630041A04RikD3Z3U4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
9630041A04RikD3Z3U4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
9630041A04RikD3Z3U4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
9630041A04RikD3Z3U4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
9630041A04RikD3Z3U4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
9630041A04RikD3Z3U4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
9630041A04RikD3Z3U4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
9630041A04RikD3Z3U4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
9630041A04RikD3Z3U4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
9630041A04RikD3Z3U4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
9630041A04RikD3Z3U4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
9630041A04RikD3Z3U4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
9630041A04RikD3Z3U4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
9630041A04RikD3Z3U4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
9630041A04RikD3Z3U4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
9630041A04RikD3Z3U4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
9630041A04RikD3Z3U4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
9630041A04RikD3Z3U4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 335.5 ms