Protein–RNA interactions for Protein: D3YWJ0

Nuggc, Nuclear GTPase SLIP-GC, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NuggcD3YWJ0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NuggcD3YWJ0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NuggcD3YWJ0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NuggcD3YWJ0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NuggcD3YWJ0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NuggcD3YWJ0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NuggcD3YWJ0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NuggcD3YWJ0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NuggcD3YWJ0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NuggcD3YWJ0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NuggcD3YWJ0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NuggcD3YWJ0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NuggcD3YWJ0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NuggcD3YWJ0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NuggcD3YWJ0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NuggcD3YWJ0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NuggcD3YWJ0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NuggcD3YWJ0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NuggcD3YWJ0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NuggcD3YWJ0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NuggcD3YWJ0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NuggcD3YWJ0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NuggcD3YWJ0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NuggcD3YWJ0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NuggcD3YWJ0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NuggcD3YWJ0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NuggcD3YWJ0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NuggcD3YWJ0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NuggcD3YWJ0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NuggcD3YWJ0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NuggcD3YWJ0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NuggcD3YWJ0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NuggcD3YWJ0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NuggcD3YWJ0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NuggcD3YWJ0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NuggcD3YWJ0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NuggcD3YWJ0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NuggcD3YWJ0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NuggcD3YWJ0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NuggcD3YWJ0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NuggcD3YWJ0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NuggcD3YWJ0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NuggcD3YWJ0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NuggcD3YWJ0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NuggcD3YWJ0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NuggcD3YWJ0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NuggcD3YWJ0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NuggcD3YWJ0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NuggcD3YWJ0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NuggcD3YWJ0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NuggcD3YWJ0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NuggcD3YWJ0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NuggcD3YWJ0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NuggcD3YWJ0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NuggcD3YWJ0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NuggcD3YWJ0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NuggcD3YWJ0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NuggcD3YWJ0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NuggcD3YWJ0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NuggcD3YWJ0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NuggcD3YWJ0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NuggcD3YWJ0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NuggcD3YWJ0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NuggcD3YWJ0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NuggcD3YWJ0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NuggcD3YWJ0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NuggcD3YWJ0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NuggcD3YWJ0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NuggcD3YWJ0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NuggcD3YWJ0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NuggcD3YWJ0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NuggcD3YWJ0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NuggcD3YWJ0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NuggcD3YWJ0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NuggcD3YWJ0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NuggcD3YWJ0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NuggcD3YWJ0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NuggcD3YWJ0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NuggcD3YWJ0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NuggcD3YWJ0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NuggcD3YWJ0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NuggcD3YWJ0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NuggcD3YWJ0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NuggcD3YWJ0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NuggcD3YWJ0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NuggcD3YWJ0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NuggcD3YWJ0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NuggcD3YWJ0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NuggcD3YWJ0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NuggcD3YWJ0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NuggcD3YWJ0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NuggcD3YWJ0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NuggcD3YWJ0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NuggcD3YWJ0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NuggcD3YWJ0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NuggcD3YWJ0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NuggcD3YWJ0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NuggcD3YWJ0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NuggcD3YWJ0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NuggcD3YWJ0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms