Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rexo5D3YW29 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rexo5D3YW29 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rexo5D3YW29 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rexo5D3YW29 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rexo5D3YW29 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rexo5D3YW29 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rexo5D3YW29 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rexo5D3YW29 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rexo5D3YW29 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rexo5D3YW29 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Rexo5D3YW29 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rexo5D3YW29 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rexo5D3YW29 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rexo5D3YW29 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rexo5D3YW29 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rexo5D3YW29 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rexo5D3YW29 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rexo5D3YW29 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rexo5D3YW29 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rexo5D3YW29 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rexo5D3YW29 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rexo5D3YW29 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Rexo5D3YW29 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rexo5D3YW29 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Rexo5D3YW29 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rexo5D3YW29 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rexo5D3YW29 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rexo5D3YW29 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rexo5D3YW29 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rexo5D3YW29 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rexo5D3YW29 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rexo5D3YW29 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rexo5D3YW29 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rexo5D3YW29 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rexo5D3YW29 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rexo5D3YW29 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rexo5D3YW29 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rexo5D3YW29 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rexo5D3YW29 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rexo5D3YW29 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rexo5D3YW29 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rexo5D3YW29 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rexo5D3YW29 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rexo5D3YW29 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rexo5D3YW29 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rexo5D3YW29 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rexo5D3YW29 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rexo5D3YW29 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rexo5D3YW29 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rexo5D3YW29 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rexo5D3YW29 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rexo5D3YW29 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rexo5D3YW29 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rexo5D3YW29 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rexo5D3YW29 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rexo5D3YW29 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rexo5D3YW29 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rexo5D3YW29 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rexo5D3YW29 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rexo5D3YW29 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rexo5D3YW29 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rexo5D3YW29 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rexo5D3YW29 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rexo5D3YW29 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rexo5D3YW29 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rexo5D3YW29 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rexo5D3YW29 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rexo5D3YW29 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rexo5D3YW29 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rexo5D3YW29 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rexo5D3YW29 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rexo5D3YW29 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rexo5D3YW29 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rexo5D3YW29 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Rexo5D3YW29 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rexo5D3YW29 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rexo5D3YW29 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rexo5D3YW29 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rexo5D3YW29 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rexo5D3YW29 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rexo5D3YW29 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rexo5D3YW29 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rexo5D3YW29 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rexo5D3YW29 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rexo5D3YW29 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rexo5D3YW29 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rexo5D3YW29 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rexo5D3YW29 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rexo5D3YW29 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rexo5D3YW29 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rexo5D3YW29 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rexo5D3YW29 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rexo5D3YW29 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Rexo5D3YW29 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rexo5D3YW29 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rexo5D3YW29 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rexo5D3YW29 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rexo5D3YW29 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rexo5D3YW29 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms