Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip3B9EHT4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clip3B9EHT4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip3B9EHT4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip3B9EHT4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip3B9EHT4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip3B9EHT4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip3B9EHT4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip3B9EHT4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip3B9EHT4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip3B9EHT4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip3B9EHT4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip3B9EHT4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip3B9EHT4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip3B9EHT4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip3B9EHT4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip3B9EHT4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip3B9EHT4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip3B9EHT4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip3B9EHT4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip3B9EHT4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip3B9EHT4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip3B9EHT4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip3B9EHT4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip3B9EHT4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip3B9EHT4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip3B9EHT4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip3B9EHT4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip3B9EHT4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip3B9EHT4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip3B9EHT4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip3B9EHT4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip3B9EHT4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip3B9EHT4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clip3B9EHT4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clip3B9EHT4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clip3B9EHT4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip3B9EHT4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip3B9EHT4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip3B9EHT4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip3B9EHT4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip3B9EHT4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip3B9EHT4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip3B9EHT4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip3B9EHT4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip3B9EHT4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip3B9EHT4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip3B9EHT4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip3B9EHT4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip3B9EHT4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip3B9EHT4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip3B9EHT4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip3B9EHT4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip3B9EHT4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip3B9EHT4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip3B9EHT4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip3B9EHT4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip3B9EHT4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip3B9EHT4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip3B9EHT4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip3B9EHT4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip3B9EHT4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip3B9EHT4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip3B9EHT4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip3B9EHT4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clip3B9EHT4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip3B9EHT4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip3B9EHT4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip3B9EHT4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip3B9EHT4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip3B9EHT4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip3B9EHT4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip3B9EHT4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip3B9EHT4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip3B9EHT4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip3B9EHT4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip3B9EHT4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip3B9EHT4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip3B9EHT4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip3B9EHT4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip3B9EHT4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip3B9EHT4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip3B9EHT4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip3B9EHT4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip3B9EHT4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip3B9EHT4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip3B9EHT4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip3B9EHT4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip3B9EHT4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip3B9EHT4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip3B9EHT4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip3B9EHT4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip3B9EHT4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip3B9EHT4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip3B9EHT4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip3B9EHT4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip3B9EHT4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip3B9EHT4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clip3B9EHT4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clip3B9EHT4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms