Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trabd2bB1ATG9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trabd2bB1ATG9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trabd2bB1ATG9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trabd2bB1ATG9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trabd2bB1ATG9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trabd2bB1ATG9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trabd2bB1ATG9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trabd2bB1ATG9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trabd2bB1ATG9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trabd2bB1ATG9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trabd2bB1ATG9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trabd2bB1ATG9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trabd2bB1ATG9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trabd2bB1ATG9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trabd2bB1ATG9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trabd2bB1ATG9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trabd2bB1ATG9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trabd2bB1ATG9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trabd2bB1ATG9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trabd2bB1ATG9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trabd2bB1ATG9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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