Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trabd2bB1ATG9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trabd2bB1ATG9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trabd2bB1ATG9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trabd2bB1ATG9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trabd2bB1ATG9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trabd2bB1ATG9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trabd2bB1ATG9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trabd2bB1ATG9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trabd2bB1ATG9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trabd2bB1ATG9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trabd2bB1ATG9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trabd2bB1ATG9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trabd2bB1ATG9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trabd2bB1ATG9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trabd2bB1ATG9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trabd2bB1ATG9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trabd2bB1ATG9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trabd2bB1ATG9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trabd2bB1ATG9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trabd2bB1ATG9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trabd2bB1ATG9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trabd2bB1ATG9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trabd2bB1ATG9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trabd2bB1ATG9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trabd2bB1ATG9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms