Protein–RNA interactions for Protein: A2RT62

Fbxl16, F-box/LRR-repeat protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxl16A2RT62 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Fbxl16A2RT62 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Fbxl16A2RT62 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Fbxl16A2RT62 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Fbxl16A2RT62 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28,8■■■□□ 2,2
Fbxl16A2RT62 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Fbxl16A2RT62 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Fbxl16A2RT62 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Fbxl16A2RT62 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Fbxl16A2RT62 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28,78■■■□□ 2,2
Fbxl16A2RT62 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Fbxl16A2RT62 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Fbxl16A2RT62 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Fbxl16A2RT62 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28,76■■■□□ 2,2
Fbxl16A2RT62 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28,75■■■□□ 2,19
Fbxl16A2RT62 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Fbxl16A2RT62 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Fbxl16A2RT62 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Fbxl16A2RT62 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Fbxl16A2RT62 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Fbxl16A2RT62 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Fbxl16A2RT62 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Fbxl16A2RT62 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Fbxl16A2RT62 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Fbxl16A2RT62 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Fbxl16A2RT62 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Fbxl16A2RT62 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Fbxl16A2RT62 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Fbxl16A2RT62 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Fbxl16A2RT62 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Fbxl16A2RT62 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Fbxl16A2RT62 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Fbxl16A2RT62 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Fbxl16A2RT62 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Fbxl16A2RT62 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Fbxl16A2RT62 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Fbxl16A2RT62 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Fbxl16A2RT62 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Fbxl16A2RT62 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Fbxl16A2RT62 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Fbxl16A2RT62 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Fbxl16A2RT62 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28,61■■■□□ 2,17
Fbxl16A2RT62 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Fbxl16A2RT62 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Fbxl16A2RT62 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Fbxl16A2RT62 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Fbxl16A2RT62 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28,59■■■□□ 2,17
Fbxl16A2RT62 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Fbxl16A2RT62 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Fbxl16A2RT62 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Fbxl16A2RT62 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Fbxl16A2RT62 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Fbxl16A2RT62 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Fbxl16A2RT62 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Fbxl16A2RT62 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Fbxl16A2RT62 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Fbxl16A2RT62 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Fbxl16A2RT62 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Fbxl16A2RT62 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Fbxl16A2RT62 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Fbxl16A2RT62 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Fbxl16A2RT62 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Fbxl16A2RT62 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Fbxl16A2RT62 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Fbxl16A2RT62 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Fbxl16A2RT62 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,15
Fbxl16A2RT62 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Fbxl16A2RT62 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Fbxl16A2RT62 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Fbxl16A2RT62 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Fbxl16A2RT62 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Fbxl16A2RT62 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Fbxl16A2RT62 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Fbxl16A2RT62 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Fbxl16A2RT62 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Fbxl16A2RT62 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Fbxl16A2RT62 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Fbxl16A2RT62 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Fbxl16A2RT62 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Fbxl16A2RT62 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Fbxl16A2RT62 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Fbxl16A2RT62 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Fbxl16A2RT62 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Fbxl16A2RT62 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Fbxl16A2RT62 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Fbxl16A2RT62 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Fbxl16A2RT62 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Fbxl16A2RT62 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Fbxl16A2RT62 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Fbxl16A2RT62 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Fbxl16A2RT62 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Fbxl16A2RT62 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Fbxl16A2RT62 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Fbxl16A2RT62 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Fbxl16A2RT62 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Fbxl16A2RT62 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Fbxl16A2RT62 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Fbxl16A2RT62 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,12
Fbxl16A2RT62 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Fbxl16A2RT62 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms