Protein–RNA interactions for Protein: A2A7F4

Rlf, MCG122876, mousemouse

Predictions only

Length 1,918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RlfA2A7F4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RlfA2A7F4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RlfA2A7F4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RlfA2A7F4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RlfA2A7F4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RlfA2A7F4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RlfA2A7F4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RlfA2A7F4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RlfA2A7F4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RlfA2A7F4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RlfA2A7F4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RlfA2A7F4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RlfA2A7F4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RlfA2A7F4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RlfA2A7F4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RlfA2A7F4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RlfA2A7F4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RlfA2A7F4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RlfA2A7F4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RlfA2A7F4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RlfA2A7F4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RlfA2A7F4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RlfA2A7F4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RlfA2A7F4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RlfA2A7F4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RlfA2A7F4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RlfA2A7F4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RlfA2A7F4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RlfA2A7F4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RlfA2A7F4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RlfA2A7F4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RlfA2A7F4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RlfA2A7F4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RlfA2A7F4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RlfA2A7F4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RlfA2A7F4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RlfA2A7F4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RlfA2A7F4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RlfA2A7F4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RlfA2A7F4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RlfA2A7F4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RlfA2A7F4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RlfA2A7F4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RlfA2A7F4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RlfA2A7F4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RlfA2A7F4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RlfA2A7F4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RlfA2A7F4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RlfA2A7F4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RlfA2A7F4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RlfA2A7F4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RlfA2A7F4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RlfA2A7F4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RlfA2A7F4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RlfA2A7F4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RlfA2A7F4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RlfA2A7F4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RlfA2A7F4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RlfA2A7F4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RlfA2A7F4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RlfA2A7F4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RlfA2A7F4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RlfA2A7F4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RlfA2A7F4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RlfA2A7F4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RlfA2A7F4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RlfA2A7F4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RlfA2A7F4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RlfA2A7F4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RlfA2A7F4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RlfA2A7F4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RlfA2A7F4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RlfA2A7F4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RlfA2A7F4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RlfA2A7F4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RlfA2A7F4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RlfA2A7F4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RlfA2A7F4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RlfA2A7F4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RlfA2A7F4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RlfA2A7F4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RlfA2A7F4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RlfA2A7F4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RlfA2A7F4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RlfA2A7F4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RlfA2A7F4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RlfA2A7F4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RlfA2A7F4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RlfA2A7F4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RlfA2A7F4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RlfA2A7F4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RlfA2A7F4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RlfA2A7F4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RlfA2A7F4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RlfA2A7F4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RlfA2A7F4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RlfA2A7F4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RlfA2A7F4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RlfA2A7F4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RlfA2A7F4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 268.1 ms