Protein–RNA interactions for Protein: A2A7F4

Rlf, MCG122876, mousemouse

Predictions only

Length 1,918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RlfA2A7F4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,1■■□□□ 1,61
RlfA2A7F4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
RlfA2A7F4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
RlfA2A7F4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25,08■■□□□ 1,61
RlfA2A7F4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
RlfA2A7F4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
RlfA2A7F4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
RlfA2A7F4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
RlfA2A7F4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
RlfA2A7F4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
RlfA2A7F4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
RlfA2A7F4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
RlfA2A7F4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,04■■□□□ 1,6
RlfA2A7F4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,04■■□□□ 1,6
RlfA2A7F4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25,03■■□□□ 1,6
RlfA2A7F4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
RlfA2A7F4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
RlfA2A7F4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1,59
RlfA2A7F4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25■■□□□ 1,59
RlfA2A7F4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
RlfA2A7F4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
RlfA2A7F4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25■■□□□ 1,59
RlfA2A7F4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
RlfA2A7F4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24,98■■□□□ 1,59
RlfA2A7F4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,98■■□□□ 1,59
RlfA2A7F4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
RlfA2A7F4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
RlfA2A7F4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
RlfA2A7F4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
RlfA2A7F4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,94■■□□□ 1,58
RlfA2A7F4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24,94■■□□□ 1,58
RlfA2A7F4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
RlfA2A7F4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
RlfA2A7F4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24,92■■□□□ 1,58
RlfA2A7F4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
RlfA2A7F4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
RlfA2A7F4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
RlfA2A7F4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
RlfA2A7F4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,92■■□□□ 1,58
RlfA2A7F4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
RlfA2A7F4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24,9■■□□□ 1,58
RlfA2A7F4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24,89■■□□□ 1,58
RlfA2A7F4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
RlfA2A7F4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24,89■■□□□ 1,58
RlfA2A7F4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24,89■■□□□ 1,58
RlfA2A7F4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
RlfA2A7F4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
RlfA2A7F4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
RlfA2A7F4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
RlfA2A7F4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24,87■■□□□ 1,57
RlfA2A7F4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
RlfA2A7F4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
RlfA2A7F4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
RlfA2A7F4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
RlfA2A7F4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
RlfA2A7F4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24,85■■□□□ 1,57
RlfA2A7F4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
RlfA2A7F4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
RlfA2A7F4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,56
RlfA2A7F4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24,82■■□□□ 1,56
RlfA2A7F4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
RlfA2A7F4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24,81■■□□□ 1,56
RlfA2A7F4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
RlfA2A7F4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24,8■■□□□ 1,56
RlfA2A7F4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24,8■■□□□ 1,56
RlfA2A7F4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,8■■□□□ 1,56
RlfA2A7F4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
RlfA2A7F4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
RlfA2A7F4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24,78■■□□□ 1,56
RlfA2A7F4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
RlfA2A7F4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
RlfA2A7F4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
RlfA2A7F4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
RlfA2A7F4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24,76■■□□□ 1,55
RlfA2A7F4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
RlfA2A7F4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24,75■■□□□ 1,55
RlfA2A7F4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
RlfA2A7F4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24,74■■□□□ 1,55
RlfA2A7F4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
RlfA2A7F4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24,74■■□□□ 1,55
RlfA2A7F4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
RlfA2A7F4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
RlfA2A7F4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
RlfA2A7F4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
RlfA2A7F4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24,71■■□□□ 1,55
RlfA2A7F4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
RlfA2A7F4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,54
RlfA2A7F4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
RlfA2A7F4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
RlfA2A7F4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24,69■■□□□ 1,54
RlfA2A7F4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,69■■□□□ 1,54
RlfA2A7F4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
RlfA2A7F4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24,69■■□□□ 1,54
RlfA2A7F4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
RlfA2A7F4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
RlfA2A7F4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24,69■■□□□ 1,54
RlfA2A7F4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
RlfA2A7F4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24,67■■□□□ 1,54
RlfA2A7F4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
RlfA2A7F4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,6 ms