Protein–RNA interactions for Protein: A2A5R2

Arfgef2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef2A2A5R2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Arfgef2A2A5R2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Arfgef2A2A5R2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Arfgef2A2A5R2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Arfgef2A2A5R2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Arfgef2A2A5R2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Arfgef2A2A5R2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Arfgef2A2A5R2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Arfgef2A2A5R2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Arfgef2A2A5R2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Arfgef2A2A5R2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Arfgef2A2A5R2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Arfgef2A2A5R2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Arfgef2A2A5R2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Arfgef2A2A5R2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Arfgef2A2A5R2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Arfgef2A2A5R2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Arfgef2A2A5R2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Arfgef2A2A5R2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Arfgef2A2A5R2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Arfgef2A2A5R2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Arfgef2A2A5R2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Arfgef2A2A5R2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Arfgef2A2A5R2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Arfgef2A2A5R2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Arfgef2A2A5R2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Arfgef2A2A5R2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Arfgef2A2A5R2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Arfgef2A2A5R2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Arfgef2A2A5R2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Arfgef2A2A5R2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Arfgef2A2A5R2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Arfgef2A2A5R2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Arfgef2A2A5R2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Arfgef2A2A5R2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Arfgef2A2A5R2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Arfgef2A2A5R2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Arfgef2A2A5R2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Arfgef2A2A5R2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Arfgef2A2A5R2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Arfgef2A2A5R2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Arfgef2A2A5R2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Arfgef2A2A5R2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Arfgef2A2A5R2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Arfgef2A2A5R2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Arfgef2A2A5R2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Arfgef2A2A5R2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Arfgef2A2A5R2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Arfgef2A2A5R2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Arfgef2A2A5R2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Arfgef2A2A5R2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Arfgef2A2A5R2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Arfgef2A2A5R2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Arfgef2A2A5R2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Arfgef2A2A5R2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Arfgef2A2A5R2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Arfgef2A2A5R2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Arfgef2A2A5R2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.9 ms