Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H0

Trbv12-1, T cell receptor beta, variable 12-1 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21,84■■□□□ 1,09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21,83■■□□□ 1,09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,82■■□□□ 1,08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,81■■□□□ 1,08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21,8■■□□□ 1,08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21,8■■□□□ 1,08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21,8■■□□□ 1,08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21,79■■□□□ 1,08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,77■■□□□ 1,08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21,75■■□□□ 1,07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,74■■□□□ 1,07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21,72■■□□□ 1,07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,71■■□□□ 1,07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21,7■■□□□ 1,06
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Trbv12-1A0A0B4J1H0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Trbv12-1A0A0B4J1H0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,67■■□□□ 1,06
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21,67■■□□□ 1,06
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21,67■■□□□ 1,06
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,66■■□□□ 1,06
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21,64■■□□□ 1,05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,63■■□□□ 1,05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,62■■□□□ 1,05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21,61■■□□□ 1,05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,6■■□□□ 1,05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21,59■■□□□ 1,05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21,58■■□□□ 1,05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21,58■■□□□ 1,05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21,57■■□□□ 1,04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21,54■■□□□ 1,04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Trbv12-1A0A0B4J1H0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21,51■■□□□ 1,03
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Trbv12-1A0A0B4J1H0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,48■■□□□ 1,03
Trbv12-1A0A0B4J1H0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21,47■■□□□ 1,03
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,46■■□□□ 1,03
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Trbv12-1A0A0B4J1H0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21,46■■□□□ 1,03
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21,45■■□□□ 1,02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
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