Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm28919A0A087WP35 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm28919A0A087WP35 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm28919A0A087WP35 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm28919A0A087WP35 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm28919A0A087WP35 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm28919A0A087WP35 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm28919A0A087WP35 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm28919A0A087WP35 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm28919A0A087WP35 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm28919A0A087WP35 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm28919A0A087WP35 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm28919A0A087WP35 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm28919A0A087WP35 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm28919A0A087WP35 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm28919A0A087WP35 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm28919A0A087WP35 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm28919A0A087WP35 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm28919A0A087WP35 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm28919A0A087WP35 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm28919A0A087WP35 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm28919A0A087WP35 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm28919A0A087WP35 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm28919A0A087WP35 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm28919A0A087WP35 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm28919A0A087WP35 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm28919A0A087WP35 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm28919A0A087WP35 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm28919A0A087WP35 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm28919A0A087WP35 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm28919A0A087WP35 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm28919A0A087WP35 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm28919A0A087WP35 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm28919A0A087WP35 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gm28919A0A087WP35 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm28919A0A087WP35 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm28919A0A087WP35 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm28919A0A087WP35 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm28919A0A087WP35 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm28919A0A087WP35 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm28919A0A087WP35 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm28919A0A087WP35 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm28919A0A087WP35 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm28919A0A087WP35 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm28919A0A087WP35 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm28919A0A087WP35 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm28919A0A087WP35 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm28919A0A087WP35 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm28919A0A087WP35 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm28919A0A087WP35 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm28919A0A087WP35 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm28919A0A087WP35 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm28919A0A087WP35 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm28919A0A087WP35 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm28919A0A087WP35 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm28919A0A087WP35 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm28919A0A087WP35 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm28919A0A087WP35 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm28919A0A087WP35 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm28919A0A087WP35 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm28919A0A087WP35 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm28919A0A087WP35 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm28919A0A087WP35 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm28919A0A087WP35 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm28919A0A087WP35 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm28919A0A087WP35 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm28919A0A087WP35 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm28919A0A087WP35 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm28919A0A087WP35 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm28919A0A087WP35 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm28919A0A087WP35 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm28919A0A087WP35 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm28919A0A087WP35 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm28919A0A087WP35 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm28919A0A087WP35 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm28919A0A087WP35 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm28919A0A087WP35 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm28919A0A087WP35 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm28919A0A087WP35 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm28919A0A087WP35 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm28919A0A087WP35 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm28919A0A087WP35 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm28919A0A087WP35 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm28919A0A087WP35 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm28919A0A087WP35 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm28919A0A087WP35 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm28919A0A087WP35 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm28919A0A087WP35 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm28919A0A087WP35 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm28919A0A087WP35 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm28919A0A087WP35 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm28919A0A087WP35 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm28919A0A087WP35 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm28919A0A087WP35 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm28919A0A087WP35 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm28919A0A087WP35 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm28919A0A087WP35 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm28919A0A087WP35 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm28919A0A087WP35 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm28919A0A087WP35 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms