Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms