Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms